По неподтверждённым данным, численность православных в Индонезии составляет около 2000 человек, среди которых много местных коренных жителей. В стране служат 9 священнослужителей, и имеется несколько православных храмов. Один из них, собор святого апостола Фомы, расположенный в Джакарте, где настоятелем является отец Борис.

Богослужения в храме имеют свои особенности. При входе прихожане снимают обувь, а женщины покрывают голову платком. Мужчины и женщины стоят отдельно: мужчины, справа, женщины, слева. Все прихожане имеют книжечки с текстами Святой литургии и активно участвуют в службе, произнося даже те части, которые обычно исполняет хор.

3 ноября 2019 года в храме апостола Фомы прошло соборное служение духовенства Индонезийской миссии. Накануне было принято решение о переходе под единое каноническое управление Патриаршего экзархата Юго-Восточной Азии.