Коломенский краеведческий музей начал свою деятельность 25 августа 1932 года в Маринкиной башне Коломенского кремля. В 1936 году ему передали здание храма Михаила Архангела, которое было переоборудовано для размещения историко-краеведческой экспозиции. В 1930-е годы были заложены основы современной коломенской археологии, а также традиции проведения длительных экспедиций и исследований. Музей стал центром научной и образовательной работы в городе и его окрестностях.

В 2006 году администрация городского округа Коломны выделила для музея купеческий усадебный комплекс XIX века, который является памятником истории и культуры регионального значения. Это ознаменовало новый этап в истории музея на территории Коломенского кремля. Современная экспозиция была открыта в конце 2011 года в рамках Федеральной целевой программы «Культура России 2006, 2011» и включает зал «Природа и древний человек».

Музей предлагает групповые и индивидуальные экскурсии, а также театрализованные и интерактивные программы на различные темы для широкой аудитории.