Le musée local de Kolomna a commencé ses activités le 25 août 1932 dans la tour de Marinkina du Kremlin de Kolomna. En 1936, le bâtiment de l'église de l'archange Michel lui a été transféré, et a été réaménagé pour accueillir une exposition historique et locale. Dans les années 1930, les bases de l'archéologie moderne de Kolomna ont été posées, ainsi que les traditions de longues expéditions et recherches. Le musée est devenu un centre de travail scientifique et éducatif dans la ville et ses environs.

En 2006, l'administration du district urbain de Kolomna a attribué au musée un complexe de manoirs marchands du XIXe siècle, qui est un monument d'histoire et de culture d'importance régionale. Cela a marqué une nouvelle étape dans l'histoire du musée sur le territoire du Kremlin de Kolomna. L'exposition moderne a été inaugurée à la fin de 2011 dans le cadre du programme fédéral « Culture de la Russie 2006, 2011 » et comprend la salle « Nature et homme préhistorique ».

Le musée propose des visites guidées en groupe et individuelles, ainsi que des programmes théâtralisés et interactifs sur divers thèmes pour un large public.