Le monastère a commencé son histoire en tant qu'édifice architectural avec la construction d'une église. En 1987, l'archimandrite Georges (Sava) a dirigé la paroisse de la maison de prière de la Sainte-Ascension à Timachovsk, sur la bénédiction de l'évêque Isidore, qui était alors évêque. Le père Georges aspirait à construire une belle église en pierre, malgré de nombreuses difficultés et persécutions de la part des autorités, qui ne fournissaient pas de terrain et interdisaient la construction d'une église complète. Il a fallu se contenter d'un terrain à la périphérie de la ville, où une maison a été achetée sur un sol marécageux. Le père Georges croyait que cet endroit, tout comme Saint-Pétersbourg, construit sur un marais, deviendrait béni.

Certains doutaient du choix de l'emplacement, mais le père assurait qu'avec le temps, cela deviendrait un centre. Et en effet, peu après, deux quartiers ont vu le jour ici. Les anciens du coin se souvenaient qu'au cours des années 1950, une jeune fille folle avait prédit la construction d'une église et d'un monastère dans cette dépression. Cet endroit est devenu un symbole de renaissance de la foi, tout comme l'Église russe, ressuscitée des cendres.

Après l'achèvement de la construction de l'église en 1991, l'archimandrite Georges prévoyait de partir pour l'Éparchie d'Arkhangelsk, mais la maladie l'a retardé. L'évêque Isidore a proposé d'ouvrir un monastère masculin à Timachovsk, et le père Georges a accepté. En juin 1992, le monastère masculin Saint-Esprit a été officiellement ouvert, et l'archimandrite Georges en est devenu l'abbé.

L'ouverture du monastère a coïncidé avec une période difficile pour la Russie, lorsque les réformes et la transition vers une économie de marché ont durement affecté la population. Le monastère a également rencontré des difficultés, mais grâce au soutien de bonnes personnes, il a été possible de construire une clôture et des bâtiments. Au départ, la communauté comptait douze personnes. Le monastère suivait la règle ancienne de se nourrir du travail de ses mains. Grâce à l'aide des autorités, le monastère a reçu près de trois cents hectares de terre, qui ont ensuite été augmentés à quatre cents.

Aujourd'hui, le monastère s'occupe de l'agriculture, cultivant des céréales, des légumes et élevant du bétail. La communauté effectue également divers travaux et participe aux offices. Les services du matin commencent à quatre heures du matin et se poursuivent jusqu'à la Divine Liturgie, le soir, un vêpres est célébré. Environ quatre-vingts personnes vivent au monastère, portant leurs obédiences.

Sur le territoire du monastère se trouvent deux églises : l'église de la Transfiguration du Seigneur et l'église de la Descente du Saint-Esprit.