Das Kloster begann seine Geschichte als architektonisches Bauwerk mit dem Bau einer Kirche. 1987 übernahm Archimandrit Georgij (Sava) mit der Segnung von Bischof Isidor, der damals Bischof war, die Gemeinde des Heilig-Erhöhung-Gebetshauses in Timaschewsk. Vater Georgij strebte danach, eine schöne Steinkirche zu bauen, trotz zahlreicher Schwierigkeiten und Unterdrückungen seitens der Behörden, die kein Land zur Verfügung stellten und den Bau einer vollwertigen Kirche verboten. Man musste sich mit einem Grundstück am Stadtrand begnügen, wo ein Haus mit sumpfigem Boden gekauft wurde. Vater Georgij glaubte, dass dieser Ort, wie auch Sankt Petersburg, das auf dem Sumpf erbaut wurde, gesegnet sein würde.

Einige zweifelten an der Wahl des Standorts, aber der Priester versicherte, dass es mit der Zeit zum Zentrum werden würde. Und tatsächlich wuchsen bald zwei Wohngebiete hier. Die einheimischen Alteingesessenen erinnerten sich, dass in den 1950er Jahren ein verrücktes Mädchen den Bau einer Kirche und eines Klosters in dieser Senke vorhersagte. Dieser Ort wurde zum Symbol der Wiederbelebung des Glaubens, wie die Russische Kirche, die aus der Asche auferstand.

Nach dem Abschluss des Kirchenbaus im Jahr 1991 plante Archimandrit Georgij, in die Erzbischofschaft Archangelsk zu ziehen, aber eine Krankheit hielt ihn auf. Bischof Isidor schlug vor, ein Männerkloster in Timaschewsk zu eröffnen, und Vater Georgij stimmte zu. Im Juni 1992 wurde das Heilig-Geist-Männerkloster offiziell eröffnet, und Archimandrit Georgij wurde sein Abt.

Die Eröffnung des Klosters fiel in eine schwierige Zeit für Russland, als Reformen und der Übergang zur Marktwirtschaft die Bevölkerung stark belasteten. Das Kloster hatte ebenfalls Schwierigkeiten, aber dank der Unterstützung guter Menschen gelang es, eine Umzäunung und Gebäude zu errichten. Ursprünglich bestand die Bruderschaft aus zwölf Personen. Das Kloster folgte der alten Regel, sich von den Arbeiten seiner Hände zu ernähren. Dank der Hilfe der Behörden wurden dem Kloster fast dreihundert Hektar Land zugewiesen, die später auf vierhundert erhöht wurden.

Heute betreibt das Kloster Landwirtschaft, baut Getreide und Gemüse an und hält Vieh. Die Bruderschaft führt auch verschiedene Arbeiten aus und nimmt an Gottesdiensten teil. Die Morgengottesdienste beginnen um vier Uhr morgens und dauern bis zur Göttlichen Liturgie, abends wird die Vesper gefeiert. Im Kloster leben etwa achtzig Personen, die ihre Aufgaben erfüllen.

Auf dem Klostergelände befinden sich zwei Kirchen: die Kirche der Verklärung des Herrn und die Kirche der Herabkunft des Heiligen Geistes.