El monasterio comenzó su historia como una estructura arquitectónica con la construcción de la iglesia. En 1987, el archimandrita Georgiy (Savva), con la bendición del obispo Isidoro, que entonces era obispo, encabezó la parroquia de la Casa de Oración de Sviyato-Voznesensk en Timashevsk. El padre Georgiy se esforzó por construir un hermoso templo de piedra, a pesar de las numerosas dificultades y persecuciones por parte de las autoridades, que no asignaban tierras y prohibían construir una iglesia completa. Se tuvo que conformar con un terreno en las afueras de la ciudad, donde se compró una casa en un terreno pantanoso. El padre Georgiy creía que este lugar, al igual que San Petersburgo, construido sobre un pantano, se convertiría en un lugar bendecido.

Algunos dudaban de la elección del lugar, pero el padre aseguraba que con el tiempo se convertiría en un centro. Y de hecho, pronto crecieron aquí dos microdistritos. Los ancianos locales recordaban que en la década de 1950, una joven loca había predicho la construcción de una iglesia y un monasterio en este valle. Este lugar se convirtió en un símbolo de la resurrección de la fe, al igual que la Iglesia Rusa, que resurgió de las cenizas.

Después de completar la construcción del templo en 1991, el archimandrita Georgiy planeaba ir a la Diócesis de Arkhangelsk, pero una enfermedad lo retuvo. El obispo Isidoro propuso abrir un monasterio masculino en Timashevsk, y el padre Georgiy aceptó. En junio de 1992, el monasterio masculino de Sviyato-Dukh fue oficialmente inaugurado, y el archimandrita Georgiy se convirtió en su superior.

La apertura del monasterio coincidió con un momento difícil para Rusia, cuando las reformas y la transición a una economía de mercado afectaron gravemente a la población. El monasterio también enfrentó dificultades, pero gracias al apoyo de personas bondadosas, se logró construir una cerca y edificios. Inicialmente, la comunidad contaba con doce personas. El monasterio seguía la antigua regla de alimentarse del trabajo de sus manos. Gracias a la ayuda de las autoridades, se le asignaron casi trescientos hectáreas de tierra, que luego se ampliaron a cuatrocientos.

Hoy en día, el monasterio se dedica a la agricultura, cultivando cereales, verduras y criando ganado. La comunidad también realiza diversos trabajos y participa en los servicios religiosos. Los servicios matutinos comienzan a las cuatro de la mañana y continúan hasta la Divina Liturgia, y por la tarde se celebra la víspera. En el monasterio viven alrededor de ochenta personas que llevan a cabo sus obediencias.

En el territorio del monasterio se encuentran dos templos: la iglesia de la Transfiguración del Señor y la iglesia de la Descensión del Espíritu Santo.