Jusqu'en 1819, le monastère s'appelait « Monastère féminin Pokrovsky de Ryazan » et était connu du peuple sous le nom de désert d'Agrafenina. Il était situé près du lac Koutsky, non loin de Ryazan.

Le 18 juin 1819, le monastère a été transféré sur la Montagne Noire dans la partie est de la ville de Mikhaylov, et en mai 1820, les cellules y ont également été déplacées. Le monastère a reçu l'église funéraire de la Résurrection du Christ. En 1919, le pouvoir soviétique a fermé le monastère, confisqué et pillé ses biens, et les églises ont été scellées. Peu après, un détachement de soldats rouges s'est installé sur le territoire du monastère, et quelques années plus tard, une ferme porcine y a été aménagée. À la fin des années 1950, tous les bâtiments du monastère avaient été complètement démolis. En 1998, les habitants de Mikhaylov ont construit une église-chapelle en l'honneur de l'icône de la Mère de Dieu « Recherche des perdus ».

L'église a été consacrée par le métropolite de Ryazan et de Kasimov, Simon Novikov, le 10 octobre 1999. Le 6 octobre 1999, le Saint-Synode a béni l'ouverture du monastère féminin Pokrovsky pour la reprise de la vie monastique. Le 27 mai 2001, l'église de la Protection de la Sainte Vierge a été consacrée.

Le 2 juillet 2005, l'archevêque de Ryazan et de Kasimov, Pavel Ponomaryov, a posé la première pierre de la cathédrale restaurée avec le principal autel en l'honneur de la Protection de la Sainte Vierge.

Le 11 septembre 2007, avec la bénédiction de l'archevêque de Ryazan et de Kasimov, Pavel, la première pierre du temple de la porte a été posée en l'honneur du saint apôtre et évangéliste Jean le Théologien.

Le monastère dispose d'une école du dimanche et d'une bibliothèque. Il y a également une petite ferme avec de l'élevage de volailles et d'animaux. Une cantine est prévue pour les pèlerins, mais il n'y a pas d'hôtel séparé, et le bâtiment résidentiel peut accueillir au maximum 12 à 15 personnes.

Actuellement, des travaux de restauration sont en cours au monastère : la cathédrale est en cours de reconstruction, la clôture du monastère est en cours de construction et un jardin est en cours d'aménagement.