En 1834, lors de sa visite au monastère d'Ipatiev, l'empereur Nicolas Ier ordonna de redonner au corps épiscopal son "aspect ancien". À l'emplacement des anciennes Portes Saintes, de nouvelles avec une église sur la porte en l'honneur des saints Chrysanthes et Daria devaient apparaître. Les "Bulletins diocésains de Kostroma" décrivaient l'idée de créer un nouveau temple, notant qu'en 1612 et 1812, la Russie avait traversé de lourdes épreuves, et le 19 mars était devenu un jour symbolique de salut pour le pays. En 1613, le tsar Michel Fiodorovitch quitta le monastère d'Ipatiev pour rétablir l'ordre en Russie, et en 1814, l'empereur Alexandre le Bienheureux entra à Paris pour apaiser l'Europe. En mémoire de ces événements, Nicolas Ier ordonna de construire dans le monastère un temple en l'honneur des saints martyrs Chrysanthes et Daria, dont la mémoire est célébrée le 19 mars. Sur les murs du temple, il était prévu de représenter le cortège de Michel Fiodorovitch et l'entrée d'Alexandre Ier à Paris. Des fonds considérables furent alloués à la construction du temple. En 1836, la façade est de la résidence épiscopale et les vestiges des anciennes portes furent démontés pour ériger de nouvelles portes avec une église sur la porte selon le projet de l'architecte provincial Outine. Le principal créateur de l'ensemble monastique du XIXe siècle, y compris l'église, fut le professeur d'architecture K.A. Ton. Le 25 juin 1840, le jour de la naissance de Nicolas Ier, le temple en l'honneur des saints Chrysanthes et Daria fut posé dans le monastère. La façade du temple correspondait à celle de la Tour Verte, qui se trouvait de l'autre côté du monastère. La construction avançait rapidement, mais le 2 août 1841, les voûtes de l'église s'effondrèrent en raison de la hâte des travaux et des conditions météorologiques défavorables. Après enquête sur les causes de l'effondrement, de nouveaux fondements furent posés, et en 1852, selon le projet de l'architecte N.P. Grigoriev, une nouvelle construction commença. Cette fois, les travaux furent couronnés de succès, et en 1859, le temple fut consacré par l'évêque de Kostroma et de Galitch, Platon, un éminent érudit et écrivain ecclésiastique.

Le 4 novembre 2005, l'archevêque de Kostroma et de Galitch, Alexandre, consacra la croix installée sur le temple le 15 novembre. Le 6 avril 2008, l'archevêque Alexandre, accompagné des clercs et des moines du monastère, procéda à la grande consécration et à la Divine Liturgie, ce qui marqua une conclusion digne des efforts des croyants et des ascètes de piété de notre temps.