Les données d'archives sur l'église de Nicolas le Miracleux dans le village de Multanovo sont peu nombreuses, car elle a été construite peu avant la révolution. Dans ce petit village de pêcheurs, qui s'est formé sur la rivière Malaïa Lebiazh'ia dans le delta de la Volga, il n'y avait pas de temple paroissial, mais une chapelle en bois en l'honneur de Saint Nicolas le Miracleux. En 1908, Multanovo comptait environ 100 foyers, où vivaient 580 personnes. Les habitants étaient des Russes, originaires des provinces supérieures de Russie, et pratiquaient l'orthodoxie. Des vieux-croyants venaient également ici, mais ne trouvaient pas de soutien. Le village était situé à quelques verstes d'un célèbre monastère masculin de la province d'Astrakhan, le monastère de Vysogorsk de Nicolas de Churkin. Officiellement, il était rattaché à la paroisse de l'église de Kazan du village de Marfino dans le district de Krasnoïarsk, où, au début du 20ème siècle, deux prêtres officiaient. Lors des grandes fêtes et pendant le Grand Carême, l'un d'eux se rendait à Multanovo pour donner la communion aux fidèles et célébrer des prières dans la chapelle. En 1907, l'ancienne chapelle était en ruine et ne pouvait accueillir tous les fidèles. Les habitants décidèrent de construire une nouvelle chapelle plus spacieuse, mais finirent par ériger une petite église, consacrée en 1909. Dans les "Bulletins diocésains d'Astrakhan" de 1909, un article mentionne la consécration de l'église à Multanovo, signé des initiales "V.P.". Il est probable que son auteur était le supérieur de l'église de Marfino, Vladimir Poliakov, sous la direction duquel l'église a été construite.

L'église de Saint Nicolas à Multanovo est restée rattachée à la paroisse de l'église de Kazan du village de Marfino. Les habitants souhaitaient avoir leur propre prêtre, mais en raison de la faible population et du manque de moyens, cela était impossible. La construction de l'église se poursuivit même après 1909, se terminant par l'ajout d'une salle à manger et d'un clocher à deux niveaux avec un toit octogonal.

Le 18 septembre 1917, par ordre de l'archevêque d'Astrakhan et de Yenotaïev, Mitrophane Krasnopolski, une paroisse indépendante fut ouverte à Multanovo, et le prêtre devint le diplômé du séminaire théologique d'Astrakhan, le père Vassili Khoutountsev.

En 1922, pendant la période de confiscation des biens ecclésiastiques, de l'église de Multanovo, le 22 août, des objets liturgiques en argent furent confisqués. La masse totale de l'argent confisqué s'élevait à 6 livres 77,5 zolotniks.

La communauté des croyants continua à utiliser l'église jusqu'en 1940, lorsque la plupart des églises furent déjà fermées. Dans le procès-verbal du comité exécutif du district de Volodarsk du 18 septembre 1940, il est noté que la communauté utilisait l'église et ses biens illégalement, car il n'y avait pas de contrat d'utilisation.

L'église de Multanovo fut fermée le 25 octobre 1940 par décision du comité exécutif du Conseil régional d'Astrakhan. Le 24 septembre 1941, il fut décidé de transférer les bâtiments des églises fermées, y compris l'église de Multanovo, au fonds d'État pour démolition et vente comme matériaux de construction. Cependant, probablement en raison de la guerre qui avait commencé, l'église survécut et fut utilisée comme entrepôt. Actuellement, sa restauration progressive est en cours.