Au XVIIIe siècle, près de la forteresse d'Enikale, une église a été construite en l'honneur de l'Assomption de la Sainte Vierge, avec une chapelle dédiée à Saint Nicolas, relevant de l'évêché grec. Après la guerre, l'église a partiellement survécu, et les services religieux ont continué dans les bâtiments restants. Pendant les années soviétiques, le temple a été fermé et les services ont cessé. Dans le bâtiment de l'ancienne église, une clinique a été installée, qui a ensuite été fermée et réaménagée en logements. Avec le temps, les habitants ont été relogés, et le bâtiment a été complètement détruit. En 2001, sur le site de l'ancienne église de l'Assomption et de la chapelle de Saint Nicolas, il a été décidé de créer l'église de Saint Nicolas au centre du village de Stroygorodok, rue Yaroshenko, 14a, où le terrain a été consacré et une croix a été restaurée.

Depuis 2002, les services religieux se sont tenus dans un conteneur métallique sur le terrain consacré, à côté duquel se trouvait un kiosque à légumes. À la demande du prêtre Vladimir Fastovitch, le kiosque a été transféré pour être reconstruit en espace ecclésiastique en 2003. Peu à peu, il a été réaménagé en église de Saint Nicolas, et le terrain a été loué.

En 2004, le Synode des Évêques de l'Église Orthodoxe Russe à l'étranger, sous la direction de l'Archimandrite Lavr, a décidé d'apporter un soutien financier à la construction de l'église, et des fonds ont été versés sur le compte de l'église. Avec cet argent, la construction de l'église a continué, enregistrée auprès du Conseil des affaires religieuses et relevant de l'Évêché d'Odessa. Jusqu'en 2007, les services religieux se sont déroulés régulièrement.

Depuis 2008, avec la bénédiction du prêtre Vladimir Fastovitch, la paroisse de Saint Nicolas est passée à l'Évêché de Simferopol et de Crimée. Le 17 décembre 2008, l'Archimandrite Lazare a émis l'ordonnance n°59 concernant la nomination du prêtre Vladimir Fastovitch à l'église de Saint Nicolas de la ville de Kertch. Le 16 novembre 2008, un statut ecclésiastique a été délivré, enregistré auprès du Conseil des affaires religieuses.