Le vieux faubourg Glazkovskoïe, bien qu'il soit plus jeune qu'Irkoutsk, est connu depuis la fin du XVIIe siècle. Certains estiment qu'Irkoutsk a commencé ici, se souvenant de l'hiver sur l'île Diatchi. Cependant, jusqu'au début du XIXe siècle, lorsque le chemin terrestre de Krougomorski a été créé, le faubourg est resté peu peuplé et pauvre, appartenant à la paroisse de l'église de la Trinité de l'autre côté de l'Angara, ce qui compliquait l'accès en intersaison. Au début du XIXe siècle, les habitants du faubourg Glazkovskoïe souhaitaient construire leur propre église. En 1811, le marchand irkoutskien N.S. Tchoupalov a proposé de construire une église en pierre au nom de Saint Nicolas dans le village de Mogilevo, mais son initiative n'a pas été réalisée, et Glazkovo est resté sans église pendant encore cinquante ans.

Le 14 novembre 1857, les habitants du faubourg se sont adressés à l'évêque d'Irkoutsk et de Nerchinsk, Eusebius, avec une demande de construction d'une église en pierre. Le starosta de l'église de la Trinité, Y.S. Malkov, a acheté un terrain au centre du faubourg, préparé les matériaux et pris en charge les frais de construction, y compris une maison pour le prêtre. Les habitants ont demandé la bénédiction pour la construction d'une église à autel unique avec un clocher en bois au nom des saints Nicolas et Innocent, avec l'organisation d'un cimetière. Le 8 décembre de la même année, Eusebius a donné son accord pour la construction, en soulignant la nécessité d'approuver le plan avec la commission de construction de la province et l'architecte.

Au printemps 1858, les approbations ont été obtenues, et le 27 avril, l'église a été posée. Avant cela, une liturgie et une procession ont eu lieu. L'importance de l'événement était soulignée par la participation de personnalités de haut rang. Le temple a été construit en un an et demi.

Le 18 septembre 1859, il a été annoncé que la construction était terminée et que le temple était prêt pour la consécration. Le 20 septembre, le temple a été consacré par Eusebius. La construction a coûté à Y.S. Malkov 10 000 roubles, et 2 000 roubles supplémentaires pour les ustensiles et les livres ont été reçus de bienfaiteurs. L'église a été construite dans le style classique avec des murs en brique et une décoration modeste.

Quatre ans plus tard, le 16 juin 1863, la construction d'une chapelle au nom de l'Assomption de la Sainte Vierge a commencé grâce aux fonds d'I.S. Mogilev. La consécration a eu lieu le 28 avril 1866. La chapelle a perturbé la symétrie du bâtiment, mais avait une entrée séparée et une abside en demi-cercle. Par la suite, seules des réparations courantes ont été effectuées dans le temple.

En 1883, le temple a été décoré à l'intérieur, et une arche a été percée, unissant les deux églises. Les travaux ont coûté 1 200 roubles, financés par les paroissiens et une subvention. Avant la Première Guerre mondiale, une extension du temple était prévue, mais la guerre et les événements qui ont suivi ont empêché cela.

La politique d'athéisme et les difficultés économiques ont conduit à un déclin de l'église. En 1932, les biens de l'église ont été pillés, et en 1933, les cloches ont été enlevées. En 1934, l'église a été fermée, le bâtiment a été transformé en club, puis en cinéma "Zarya". En 1979, le cinéma a été fermé, et le bâtiment a été abandonné.

En 1990, le bâtiment a été reconnu monument historique, et en 1994, sa restauration a commencé. En 1997, le bâtiment a été restitué au patriarcat d'Irkoutsk, et des travaux archéologiques ont commencé. En 2000, il a été décidé de construire un nouveau temple au même endroit. En 2001, la construction a commencé, achevée en 2003.

Le nouveau bâtiment correspond à l'original, mais avec un sous-sol et une coupole lumineuse. Le clocher a été orné de nouvelles cloches. Des communications modernes et un chauffage ont été installés dans le temple. En 2003, la consécration des trois chapelles du temple a eu lieu.