El viejo suburbio de Glazkovskoye, aunque más joven que Irkutsk, es conocido desde finales del siglo XVII. Algunos creen que Irkutsk comenzó aquí, recordando el invierno en la isla Dyachy. Sin embargo, hasta principios del siglo XIX, cuando se creó la ruta terrestre de Krugomorsky, el suburbio permaneció poco poblado y empobrecido, perteneciendo a la parroquia de la iglesia de la Trinidad al otro lado del Angará, lo que dificultaba el acceso a ella en temporada intermedia. A principios del siglo XIX, los habitantes del suburbio de Glazkovskoye desearon construir su propio templo. En 1811, el comerciante irkutense N.S. Chupalov propuso construir una iglesia de piedra en honor a San Nicolás en la aldea de Mogilevo, pero su iniciativa no se llevó a cabo, y Glazkovskoye permaneció sin iglesia durante medio siglo.

El 14 de noviembre de 1857, los habitantes del suburbio se dirigieron al obispo de Irkutsk y Nerchinsk, Evsevius, con la solicitud de construir una iglesia de piedra. El anciano de la iglesia de la Trinidad, Y.S. Malkov, adquirió un terreno en el centro del suburbio, preparó los materiales y asumió los gastos de construcción, incluyendo una casa para el sacerdote. Los habitantes pidieron la bendición para construir un templo de un solo altar con un campanario de madera en honor a los santos Nicolás e Inocencio, organizando un cementerio. El 8 de diciembre de ese mismo año, Evsevius dio su consentimiento para la construcción, señalando la necesidad de coordinar el plan con la comisión de construcción provincial y el arquitecto.

En la primavera de 1858 se obtuvieron las aprobaciones, y el 27 de abril se colocó la primera piedra de la iglesia. Antes de esto, se celebró una liturgia y una procesión. La importancia del evento se subrayó con la participación de personas de alto rango. El templo fue construido en un año y medio.

El 18 de septiembre de 1859 se informó sobre la finalización de la construcción y la preparación del templo para la consagración. El 20 de septiembre, el templo fue consagrado por Evsevius. La construcción costó a Y.S. Malkov 10 mil rublos, y se recibieron otros 2 mil rublos de benefactores para los utensilios y libros. La iglesia fue construida en estilo clasicista con paredes de ladrillo y una decoración modesta.

Cuatro años después, el 16 de junio de 1863, comenzó la construcción de una capilla en honor a la Asunción de la Madre de Dios con fondos de I.S. Mogilev. La consagración tuvo lugar el 28 de abril de 1866. La capilla rompió la simetría del edificio, pero tenía una entrada separada y un ábside semicircular. Posteriormente, solo se realizaron reparaciones corrientes en el templo.

En 1883, el templo fue decorado por dentro, y se abrió un arco que unió ambas iglesias. Los trabajos costaron 1,200 rublos, financiados por los feligreses y subsidios. Antes de la Primera Guerra Mundial, se planeó la expansión del templo, pero la guerra y los eventos posteriores lo impidieron.

La política de ateísmo y las dificultades económicas llevaron a la decadencia de la iglesia. En 1932, los bienes de la iglesia fueron saqueados, y en 1933 se retiraron las campanas. En 1934, la iglesia fue cerrada, el edificio se convirtió en un club y luego en el cine 'Zarya'. En 1979, el cine fue cerrado y el edificio fue abandonado.

En 1990, el edificio fue reconocido como monumento, y en 1994 comenzó su restauración. En 1997, el edificio fue devuelto a la patriarcía de Irkutsk, y comenzaron los trabajos arqueológicos. En 2000, se decidió construir una nueva iglesia en el mismo lugar. En 2001, comenzó la construcción, que se completó en 2003.

El nuevo edificio corresponde al original, pero con un sótano y una cúpula luminosa. El campanario fue adornado con nuevas campanas. En la iglesia se instalaron comunicaciones modernas y calefacción. En 2003, se consagraron los tres altares del templo.