L'histoire de l'église de Kazan commence avec la mention d'une chapelle en l'honneur de saint Jean Chrysostome, qui est enregistrée pour la première fois dans l'inventaire du monastère de 1665. Aucune information antérieure à son sujet n'a été conservée. À cette époque, il n'y avait qu'un seul autel, qui est maintenant la chapelle nord, et dans le même bâtiment se trouvait la réfectoire.

En 1747, grâce à la veuve du sous-officier Fekla Andreyevna Pashkova, résidant au monastère, une église à deux étages a été construite en l'honneur de l'icône de Kazan et du saint prince Dimitri. Cependant, moins de cinquante ans plus tard, en raison de son état de délabrement, l'église a été démolie, et les briques ont été utilisées pour construire la clôture du monastère en 1788.

En 1789, à la demande de l'abbesse du monastère, une chapelle a été ajoutée à l'église de saint Jean Chrysostome en l'honneur de l'icône de Kazan. Soixante ans plus tard, une chapelle sud a été ajoutée, consacrée au saint martyr Abraham de Bulgarie. En 1916, une châsse avec un auvent en granit a été installée dans cette chapelle, partiellement conservée jusqu'à nos jours, où reposaient ses reliques.

Ainsi, l'église a acquis une structure architecturale avec trois chapelles : la chapelle nord en l'honneur de saint Jean Chrysostome, la chapelle sud au nom du martyr Abraham de Bulgarie et la chapelle centrale en l'honneur de l'icône de Kazan. Elle a été conservée dans cet état jusqu'à nos jours. Après la révolution, le bâtiment a abrité les archives municipales, et avec la reprise de la vie monastique, l'église a été restituée au monastère.