La historia de la iglesia de Kazán comienza con la mención de una capilla en honor al santo Juan Crisóstomo, que fue registrada por primera vez en el inventario del monasterio de 1665. No se han conservado datos anteriores sobre ella. En ese momento, solo existía un altar, que ahora es la capilla del norte, y en el mismo edificio se encontraba el refectorio.

En 1747, gracias a la viuda del alférez Fekla Andreyevna Pashkova, que residía en el monasterio, se construyó una iglesia de dos pisos en honor a la icono de Kazán y al santo príncipe Dimitri. Sin embargo, menos de cincuenta años después, debido a su deterioro, la iglesia fue desmantelada y los ladrillos se utilizaron para construir la cerca del monasterio en 1788.

En 1789, a petición de la abadesa del monasterio, se añadió una capilla en honor a la icono de Kazán a la iglesia de san Juan Crisóstomo. Después de 60 años, se añadió la capilla del sur, consagrada en nombre del santo mártir Abraham de Bulgaria. En 1916, se instaló en esta capilla un relicario con un dosel de granito, que se ha conservado parcialmente hasta nuestros días, donde reposaban sus reliquias.

Así, la iglesia adquirió una estructura arquitectónica con tres capillas: la del norte en honor a san Juan Crisóstomo, la del sur en nombre del mártir Abraham de Bulgaria y la central en honor a la icono de Kazán. En esta forma se ha conservado hasta nuestros días. Después de la revolución, el edificio albergó el archivo municipal, y con la reanudación de la vida monástica, la iglesia fue devuelta al monasterio.