Le village de Pugachov a été fondé en 1811 comme un avant-poste cosaque sur ordre du tsar Alexandre Ier, qui a déplacé des cosaques des stanits de Krasnokholmskaya et Ilek de la volost d'Orenbourg. En 1877, sur le territoire de l'ancienne propriété des princes Dolgoroukov, un haras d'État, le haras Mikhaïlovski, a été créé.

La construction de l'église a commencé en 1880 sur le territoire du haras. Pour l'édification du temple, un mélange spécial avec ajout de jaune d'œuf a été utilisé. Grâce au financement généreux du prince Dolgoroukov, les travaux ont avancé rapidement, et dès 1881, la construction était achevée. La consécration de l'église a eu lieu le 30 mars 1881 en l'honneur de saint Alexis. Le temple est devenu très beau, surtout ses intérieurs. Les fenêtres sont ornées de mosaïques décoratives, le dôme est peint en bleu tendre, avec des anges représentés sur le bord, et au centre du dôme se trouve un grand "œil". Une école paroissiale a été ouverte près de l'église.

Malheureusement, le temple n'a pas duré longtemps. En 1933, il a été fermé et ensuite utilisé comme entrepôt de grains. Bien que l'église soit aujourd'hui très délabrée, elle impressionne toujours par sa beauté architecturale. Les murs restent solides, mais le bois et le plâtre ont beaucoup souffert. Dans la salle, presque aucune fresque n'a été conservée.