El Museo Local de Novokhopersk se encuentra en el centro de la ciudad, en un antiguo mansión de dos pisos construida en 1870. Originalmente, era una casa residencial que se calentaba con una única chimenea en el sótano. El aire caliente pasaba primero por debajo de los pisos del primer piso y luego entraba en los conductos en las gruesas paredes.

Después de los eventos del inicio del siglo XX, desde la década de 1930, este edificio albergó cuarteles militares. Desde mayo hasta septiembre de 1943, aquí se formó la Primera Brigada Checoslovaca bajo el mando de Ludvik Svoboda, y su cuartel también se encontraba en esta mansión.

En 1961, Ludvik Svoboda, ya como presidente de Checoslovaquia, visitó Novokhopersk. Este evento renovó la amistad entre los residentes locales y los militares checoslovacos. Delegaciones de Checoslovaquia comenzaron a visitar la ciudad con frecuencia, y los novokhopersk respondían con visitas.

Para 1973, el consejo municipal se instaló en la mansión, y en el primer piso se inauguró un pequeño museo de la amistad soviético-checoslovaca, dedicado al 30 aniversario de la creación de la primera brigada checoslovaca. El organizador del museo fue el local Alexander Alekseevich Solomentsev.

Los fondos del museo comenzaron a formarse en la década de 1980, en 1985 obtuvo estatus oficial, y en 1986 se abrió al público. Para entonces, el consejo municipal se había mudado, y toda la mansión se convirtió en museo. La exposición incluyó dos páginas significativas de la historia: una sobre los años de guerra de Checoslovaquia y otra sobre la amistad pacífica con Novokhopersk.

Hasta 1990, el museo de la amistad soviético-checoslovaca fue un objeto significativo para el Ministerio de Cultura de la URSS. Hoy en día, sigue siendo único en el espacio postsoviético.

Durante aproximadamente 25 años, el museo estuvo bajo la gestión del Consejo Municipal de Novokhopersk y fue parte de la Casa de Cultura. En 2010, se creó en su base la Institución Municipal "Museo Local de Novokhopersk" con derecho a personalidad jurídica, cuyo fundador fue la administración del distrito municipal de Novokhopersk.

Hoy en día, el museo es una institución pública bajo la gestión del distrito municipal de Novokhopersk. Las recientes renovaciones del edificio han conservado su apariencia histórica, dándole un aspecto moderno.