La historia del monasterio Belogorsky comienza en 1890, cuando el padre Stefan Lukanin visitó por primera vez la Montaña Blanca. Inspirado por lo que vio, decidió fundar aquí un monasterio misionero. En 1891 se erigió la primera cruz en la montaña, y pronto comenzó la construcción de templos y otros edificios. En 1894 se consagró el primer templo de madera, y en 1895 se completó la construcción del templo Iversky. El monasterio se desarrolló rápidamente: se construyeron nuevos edificios, se abrieron talleres y una escuela para huérfanos.

Para 1917, el monasterio se había convertido en un importante centro religioso y cultural. Sin embargo, con la llegada de los bolcheviques comenzaron las persecuciones a la iglesia. En 1918, el archimandrita Varlaam y muchos monjes fueron asesinados, y el monasterio fue saqueado. Se hicieron intentos de revitalizar el monasterio hasta 1923, pero sin éxito. En los años soviéticos, el monasterio se utilizó para diversos fines, incluyendo un hogar para discapacitados y un campo para los represaliados.

En 1990, el monasterio fue devuelto a la Iglesia Ortodoxa Rusa, y comenzó su restauración. En 1991 se reanudaron los servicios religiosos, y en 1993 el monasterio recibió el estatus de monumento arquitectónico. La restauración continúa, atrayendo a peregrinos y benefactores. En 1998 se volvió a erigir la Cruz Real, y en 1999 se aprobó el plan de desarrollo del monasterio. En la década de 2000, continuaron los trabajos de restauración de la infraestructura y los templos.