Die Geschichte des Belogorskiy Klosters beginnt im Jahr 1890, als Pater Stefan Lukanin zum ersten Mal den Weißen Berg besuchte. Inspiriert von dem Gesehenen beschloss er, hier ein Missionskloster zu gründen. 1891 wurde das erste Kreuz auf dem Berg aufgestellt, und bald begann der Bau von Kirchen und anderen Gebäuden. 1894 wurde die erste hölzerne Kirche geweiht, und 1895 wurde der Bau der Iwer-Kirche abgeschlossen. Das Kloster entwickelte sich schnell: neue Gebäude wurden errichtet, Werkstätten eröffnet und eine Schule für Waisenkinder gegründet.

Bis 1917 war das Kloster ein bedeutendes religiöses und kulturelles Zentrum. Doch mit dem Kommen der Bolschewiki begannen die Verfolgungen der Kirche. 1918 wurden der Archimandrit Varlaam und viele Mönche getötet, das Kloster wurde geplündert. Versuche, das Kloster bis 1923 wiederzubeleben, blieben erfolglos. In den sowjetischen Jahren wurde das Kloster für verschiedene Zwecke genutzt, darunter als Altenheim und Lager für Repressionen.

1990 wurde das Kloster der Russischen Orthodoxen Kirche zurückgegeben, und seine Wiederherstellung begann. 1991 wurden die Gottesdienste wieder aufgenommen, und 1993 erhielt das Kloster den Status eines Architekturdenkmals. Die Wiederherstellung geht weiter und zieht Pilger und Wohltäter an. 1998 wurde das Zarenkreuz erneut aufgestellt, und 1999 wurde der Entwicklungsplan für das Kloster genehmigt. In den 2000er Jahren wurden die Arbeiten zur Wiederherstellung der Infrastruktur und der Kirchen fortgesetzt.