En septiembre de 1917, el Santo Sínodo decidió hacer del convento de Kúntsevo de la comunidad de la Cruz de Polunin una entidad independiente. La monja Serafina fue nombrada superiora del monasterio de Kúntsevo. Era un tiempo difícil para los ortodoxos, y la comunidad de Serafina también enfrentó dificultades. En 1918, les fue confiscada la propiedad y el templo. Para continuar con los servicios religiosos, fue necesario firmar un acuerdo con las autoridades locales y elaborar un inventario de los bienes, lo cual se realizó ese mismo año.

Para finales de 1922, la comunidad fue disuelta, quedando solo el templo, que se convirtió en parroquial. El templo enfrentó dificultades; en 1922, le fueron confiscados 44 objetos de plata y una gran campana, supuestamente para ayudar a los hambrientos.

Los clérigos y feligreses del templo del venerable Serafín de Sarov en Kúntsevo se encontraron con un destino trágico. El primer rector, el protoiereo Alexander Vladimirovich Rusinov, nació en 1878 y sirvió desde 1907 hasta 1922. Sobrevivió a la construcción del templo y a los difíciles años de la revolución. En 1938, fue fusilado en el polígono de Butovo, y ahora es reconocido como santo nuevo mártir y confesor ruso.

El segundo rector, el sacerdote Serguéi Felítsin, asumió la iglesia en 1926. Serguéi Nikoláevich Felítsin nació en 1895 en el pueblo de Pogost, en la región de Moscú. Su padre era sacerdote, y él mismo se graduó del Seminario Teológico de Moscú y de la Academia. En 1937, fue arrestado y fusilado junto con el diácono V.I. Krasnokutski y otro clérigo. Felítsin y Krasnokutski también fueron reconocidos como nuevos mártires y confesores rusos.

Después del cierre del templo, su edificio fue utilizado para diversos fines: primero como instituciones infantiles, luego como empresas productivas, como la fábrica de mecánicos, la fábrica de herrajes de muebles y otras. Junto al templo se conservó un campanario de ladrillo, que después del cierre del templo se utilizó como vivienda y herrería. Durante este tiempo, el campanario perdió su segundo nivel, y las puertas sagradas fueron destruidas. El campanario de madera y las casas de los feligreses en el territorio de la comunidad fueron demolidos, y los demás edificios aparecieron en el período soviético.

En 1999, el templo fue visitado por el Patriarca Alexio II, y en 2000 se convirtió en un convento del monasterio de Savvino-Storozhevsky. En 2006, el templo recibió el estatus de convento patriarcal.

En 2004, parte de los edificios se incendió por la noche, lo que permitió excluir parte del territorio de la ley de protección de monumentos culturales. Poco después, el territorio fue vendido a una sociedad de responsabilidad limitada. Actualmente, tras el cambio de varios propietarios, se está construyendo un edificio residencial.