Im September 1917 beschloss der Heilige Synod, das Kuntsevo-Podvorje der Polunin-Kreuzerhöhungsgemeinde selbstständig zu machen. Die Nonne Seraphima wurde zur Leiterin des Kuntsevo-Klosters ernannt. Es war eine schwierige Zeit für die Orthodoxen, und die Gemeinde von Seraphima hatte ebenfalls mit Schwierigkeiten zu kämpfen. 1918 wurde der Gemeinde das Eigentum und die Kirche entzogen. Um die Gottesdienste fortzusetzen, musste ein Vertrag mit der örtlichen Verwaltung abgeschlossen und ein Inventar des Eigentums erstellt werden, was im selben Jahr geschah.

Bis Ende 1922 wurde die Gemeinde aufgelöst, und es blieb nur die Kirche, die zur Pfarrei wurde. Die Kirche hatte Schwierigkeiten, 1922 wurden ihr 44 silberne Gegenstände und eine große Glocke entzogen, angeblich zur Hilfe für die Hungernden.

Die Geistlichen und die Gemeindemitglieder der Kirche des hl. Seraphim von Sarow in Kuntsevo sahen sich einem tragischen Schicksal gegenüber. Der erste Vorsteher, Protopresbyter Alexander Wladimirowitsch Rusinow, wurde 1878 geboren und diente von 1907 bis 1922. Er erlebte den Bau der Kirche und die schweren Jahre der Revolution. 1938 wurde er auf dem Butowski-Poligon erschossen und wird heute als heiliger neuer Märtyrer und Bekenner der Russischen Kirche anerkannt.

Der zweite Vorsteher, Priester Sergej Felizyn, übernahm die Kirche 1926. Sergej Nikolajewitsch Felizyn wurde 1895 im Dorf Pogost der Region Moskau geboren. Sein Vater war Priester, und er selbst absolvierte das Moskauer Geistliche Seminar und die Akademie. 1937 wurde er verhaftet und zusammen mit dem Diakon W.I. Krasnokutski und einem weiteren Kirchenbeamten erschossen. Felizyn und Krasnokutski wurden ebenfalls als neue Märtyrer und Bekenner der Russischen Kirche anerkannt.

Nach der Schließung der Kirche wurde das Gebäude für verschiedene Zwecke genutzt: zunächst für Kinderinstitutionen, dann für Produktionsbetriebe wie die Mechanische Fabrik, die Möbelbeschlägefabrik und andere. Neben der Kirche blieb der Ziegelglockenturm erhalten, der nach der Schließung der Kirche als Wohnraum und Schmiede genutzt wurde. In dieser Zeit verlor der Glockenturm sein zweites Geschoss, und die heiligen Tore wurden zerstört. Der hölzerne Glockenturm und die Wohnhäuser auf dem Gebiet der Gemeinde wurden abgerissen, während die übrigen Gebäude in der sowjetischen Zeit entstanden.

Im Jahr 1999 besuchte Patriarch Alexius II. die Kirche, und im Jahr 2000 wurde sie zum Podvorje des Savvino-Storozhevsky-Klosters. 2006 erhielt die Kirche den Status eines Patriarchalen Podvorje.

Im Jahr 2004 brach nachts ein Teil der Gebäude in Brand, was es ermöglichte, einen Teil des Gebiets aus dem Geltungsbereich des Denkmalschutzgesetzes zu entlassen. Bald wurde das Gebiet an eine GmbH verkauft. Jetzt, nach dem Wechsel mehrerer Eigentümer, wird ein Wohnhaus gebaut.