Un cálido templo de invierno para la catedral de Juan Bautista era la iglesia dedicada a San Blas de Sebaste. Aunque no hay datos precisos sobre su construcción, probablemente fue erigida al mismo tiempo que la fría iglesia de la Origen de la Cruz. La primera mención de ella se encuentra en el "Libro de la Cien" de 1630: "Iglesia de San Blas, se sirve en invierno, imágenes y libros y velas y vestiduras y vasos de la iglesia se llevan para el invierno desde Juan, el loco por Cristo".

En 1649, el templo de Blas de Sebaste se quemó. En su lugar, según el decreto del metropolitano de Rostov y Yaroslavl del 5 de septiembre de 1650, se construyó una nueva iglesia en honor del Santo Mártir Blas, con una capilla en honor a San Cirilo de Belozersk, el milagroso.

En los "Libros de Posesiones" de 1683 se da una descripción más detallada de la iglesia de Blas de Sebaste: "Iglesia de madera cálida de dos cúpulas en nombre del santo mártir Blas, obispo de Sebaste".

En el altar de la iglesia había un Evangelio con evangelistas de cobre y una cruz revestida de cobre. Detrás del altar había una imagen de la Santísima Virgen María, la Odiquitris. En el templo, las puertas reales eran de madera, sobre ellas un deisis en siete tablas, la imagen de Blas de Sebaste con su vida, adornada con plata, y la imagen de la Anunciación de la Santísima Virgen María.

El cálido templo de la Epifanía del Señor era pequeño, con una cúpula en un cuello sordo. El techo y la cúpula eran de hierro, pintados, la cruz en la cúpula era de hierro dorado. En el lado sur del templo había un pequeño cuarto de guardia, y en el lado oeste, tres almacenes de piedra con un angosto pórtico entre ellos. Las bóvedas en la iglesia eran de piedra, los pisos de losetas, las paredes pintadas.

El altar estaba separado de la iglesia por un muro de piedra con dos puertas: las reales y las de los subdiáconos. El iconostasio del predal estaba hecho de madera con ocho columnas que sostenían cuatro cornisas. Las columnas estaban revestidas con papel dorado. El resplandor, los querubines tallados sobre las cornisas, los carteles, los marcos y toda la talla estaban dorados.

Las puertas reales estaban decoradas con tallas que representaban vides, en ellas había seis carteles: los evangelistas y la Anunciación de la Santísima Virgen María. A la derecha de las puertas reales estaban las imágenes de la Epifanía del Señor, el Santo Mártir Blas con milagros, posiblemente del primer templo de piedra, y San Nicolás el Milagroso. A la izquierda de las puertas reales estaban las imágenes de la Anunciación de la Santísima Virgen María, el Arcángel Miguel en la puerta del subdiácono y el Justo Procopio de Ustyug. Sobre las puertas reales, en los carteles, estaba representada la Última Cena, sobre ella el Espíritu Santo en forma de paloma en un resplandor, arriba, el cielo estrellado y el Señor Sabaoth tallado.

En la pared norte de la iglesia, en un kiot separado, había una imagen del Justo Juan de Ustyug con vestiduras y coronas bordadas en plata y oro, las coronas adornadas con pequeñas perlas alemanas.

El refectorio estaba separado de la iglesia por un muro de piedra con tres puertas. En los muros entre las puertas había imágenes del Todopoderoso y de la Madre de Dios de Todos los Que Lloran, con la inscripción: "Imagen verdadera del milagroso ícono de Todos los Que Lloran, que se encuentra en Moscú en la iglesia del Santo Varlaam de Jutyn, que está en la calle Ordynskaya". Sobre las puertas y las imágenes en la pared, en el estuco, estaban representados la Resurrección de Cristo, la Presentación del Señor y el Nacimiento de Cristo.