Im Oktober 1833 wurde auf einer Versammlung beschlossen, einen neuen steinernen Tempel anstelle der alten Kirche zu bauen und ihn zu Ehren des Heiligen Johannes des Täufers neu zu weihen, da sich am Friedhof ein wundertätiges Ikone befand. Allerdings waren die durch die Höhlen gesammelten Mittel unzureichend. Daher wurde im März 1838 dem Nischni-Nowgoroder Bischof Johannes mitgeteilt, dass die Bauern des Dorfes Bogomolowo im Balahninskij-Kreis den Wunsch geäußert hatten, die bestehende über dreihundert Jahre alte Holzkirche zu renovieren: die maroden Balken zu ersetzen, das Gebäude mit Schindeln zu verkleiden, ein steinernes Fundament zu legen, im Speisesaal einen warmen Altar zu Ehren des Heiligen Johannes des Täufers einzurichten und eine Kuppel zu installieren, die zuvor nicht vorhanden war.

Nach den Regeln jener Zeit erforderten solche umfangreichen Arbeiten die Aufsicht eines professionellen Architekten. Daher wurde der Architekt Anisimov aus dem Nischni-Nowgoroder Fürstentum nach Bogomolowo geschickt. Er berichtete, dass er den Plan der Kirche mit den bestehenden Fassaden aufgenommen hatte und auf Wunsch der Gemeindemitglieder eine neue Kuppel hinzugefügt hatte.

Die Umgestaltung des Tempels dauerte ziemlich lange. Erst Ende 1839 wurden im Speisesaal die Altäre zu Ehren des Propheten Elias und Johannes des Täufers geweiht. Der Hauptaltar wurde erst im November 1841 geweiht.

In der Mitte des 19. Jahrhunderts wurde in der Liste der Siedlungen des Russischen Kaiserreichs vermerkt, dass der Friedhof Bogomolowo an dem Fluss Pustokha lag. Dort befand sich eine orthodoxe Kirche, vier Wohnhäuser, in denen sechs Männer und fünf Frauen lebten.

So trat das kleine, aber als geistliches Zentrum anerkannte Bogomolowo ins 20. Jahrhundert ein, ein Jahrhundert sozialer Umwälzungen, Revolutionen und grundlegender Veränderungen, die die jahrhundertealten Lebensweisen der russischen Provinz, wie sie an der Schwelle des 19. und 20. Jahrhunderts im Dorf Bogomolowo waren, störten.