Die Erscheinungskirche ist ein beeindruckendes zweigeschossiges Gebäude. Historische Daten belegen, dass dies bereits die fünfte Kirche mit diesem Namen am selben Ort ist. Die erste hölzerne Kirche wurde von Priester Theophilakt errichtet, hatte eine Kapelle des heiligen Georgs des Siegers und brannte 1650 nieder. Die zweite hölzerne Kirche, die von seiner Frau und seinen Söhnen gebaut wurde, brannte 1726 nieder. Die dritte hölzerne Kirche ohne Kapellen wurde 1740 erbaut und 1770 abgerissen. Die vierte steinerne Kirche mit drei Altären wurde 1776 erbaut. Die fünfte Kirche wurde unter der Äbtissin Eusebia 1811 errichtet und 1813 geweiht, sie existiert bis heute. Zu dieser Zeit wurden in ihr Kapellen eingerichtet: die rechte im Namen der Gottesmutter von Bogoljub, die linke für alle Heiligen, und unten die Krankenhauskirche zu Ehren des Ikone der Gottesmutter „Freude aller Trauernden“. Das Gebäude hat eine rechteckige Form, drei Schiffe und wurde im klassizistischen Stil mit einer kleinen Kuppel über dem Querschiff erbaut.

Bis 1913 war das Kloster vollständig instand gesetzt. Alle Gebäude waren gestrichen und geweißt, und die ordentlichen Wege und Blumenbeete erfreuten das Auge. Die Innenausstattung der Kirchen mit geschnitzten Ikonostasen und zahlreichen Ikonen sowie wertvollen kirchlichen Gegenständen war das Ergebnis der Arbeit von 325 Nonnen. In der Klosterwerkstatt nähten die Schwestern kirchliche Gewänder und schmückten sie mit goldenen Stickereien. Die architektonischen Formen der Gebäude, die leuchtend blauen Kuppeln mit goldenen Sternen und Kreuzen begeisterten die Gäste der Stadt und waren der Stolz der Arzamasser. Die Kirche ist eines der Schlüsseldokumente, die das Erscheinungsbild des Kathedralenplatzes von Arzamas prägen.

Das friedliche Leben des Klosters wurde durch die Oktoberrevolution von 1917 gestört. 1918 zogen Teile der Roten Armee in Arzamas ein, und im Heiligen Nikolaus Kloster wurden Soldaten untergebracht. Die Arbeitsgemeinschaft der Schwestern wurde aufgelöst, und das Kloster wurde 1928 geschlossen. Teile der Gebäude wurden für verschiedene Zwecke genutzt, und die Kirchen verfielen allmählich. Die Erscheinungskirche wurde der Staatsbank übergeben, später wurde darin ein Geschäft eingerichtet. 1994 wurde das Kloster den Gläubigen zurückgegeben, und bald wurde die Kuppel der Erscheinungskirche wiederhergestellt. Im selben Jahr wurde die obere Winterkapelle zu Ehren der Erscheinung des Herrn geweiht.

Heute ist die Erscheinungskirche der Hauptort für Gottesdienste. Sie ist warm und gemütlich, mit erhaltenen alten Ikonen, in ihr werden Teile der Reliquien großer Heiliger sowie Ikonen der seligen Matrona von Moskau und der heiligen Märtyrerin Tatiana mit Reliquien aufbewahrt.

Im unteren Teil der Erscheinungskirche befand sich die Krankenhauskirche zu Ehren der Ikone der Gottesmutter „Freude aller Trauernden, mit Groschen“. Dieses Name hat die Kirche bis heute bewahrt. Jetzt befinden sich in dieser Kirche zwei Heiligtümer des Klosters: die Ikonen der Gottesmutter „Befreiung von den Nöten der Leidenden“ und „Es ist würdig“ aus Holz. Hier wird auch ein vorrevolutionäres Leichentuch aufbewahrt, das mit silbernem Faden gestickt ist.