Одним из самых заметных зданий Евпатории является величественный Свято-Николаевский собор, который выделяется своими размерами и архитектурной красотой, возвышаясь над городской застройкой.

Этот храм, несомненно, является главной доминантой исторической части Евпатории наряду с мечетью Джума-Джами и церковью святого Пророка Ильи, формируя архитектурный облик города со стороны моря. В конце XIX, начале XX века собор казался еще более грандиозным, так как находился среди преимущественно одноэтажных зданий. В его окружении были лишь два двухэтажных здания европейского типа XIX века, а основная застройка вокруг собора начала формироваться после его завершения, во многом благодаря ему.

Еще в 1774 году в Гезлёве, старом названии Евпатории, существовал небольшой храм Святителя Николая, построенный местными греками. В 1779 году город избежал эпидемии чумы благодаря строгим карантинным мерам, введенным военным гарнизоном под командованием А.В. Суворова. Суворов посещал церковь Святителя Николая и пел в ее хоре. В 2004 году рядом с собором был установлен памятник Суворову.

В 1805 году была построена новая церковь Святителя Николая, но она сильно пострадала во время Крымской войны и обветшала. К концу XIX века православные русские и греки составляли почти половину населения города, что вызвало необходимость строительства нового храма.

Преосвященный Иннокентий в своем отчете Святейшему Синоду упоминал, что в Крыму много мусульман, предки которых были христианами. В 1859 году Александр II поддержал открытие епархии Русской Православной Церкви на полуострове.

Свято-Николаевский собор был заложен 11 июля 1893 года в память освобождения Евпатории от англо-франко-турецких войск. Его строительство началось под руководством епископа Мартиниана и священника Федора Туровского. 16 февраля 1899 года собор был торжественно освящен епископом Никоном.

Этот собор считается подобием Святой Софии в Константинополе. Его огромный купол, прорезанный окнами, и боковые куполки придают ему сходство с храмом в древней Византии.

Архитектор Александр Иосифович Бернардацци спроектировал собор на 2000 верующих, сделав его важной частью архитектурного облика Евпатории. Собор, выполненный по расчетам В.А. Геренека, представляет собой восьмиугольное здание с монолитным бетонным куполом диаметром 18 метров. Это инженерное новшество того времени отличается оригинальностью и смелостью. Боковые куполки служат контрфорсами, поддерживая главный купол, а квадратная колокольня завершает композицию.

Бернардацци удачно вписал собор в морской пейзаж, сделав его центром архитектурного облика Евпатории.