Eines der auffälligsten Gebäude in Jewpatorija ist die majestätische Heilig-Nikolaus-Kathedrale, die sich durch ihre Größe und architektonische Schönheit auszeichnet und über die städtische Bebauung hinausragt.

Diese Kirche ist zweifellos das Hauptmerkmal des historischen Teils von Jewpatorija, zusammen mit der Dschuma-Dschami-Moschee und der Kirche des heiligen Propheten Elia, und prägt das architektonische Erscheinungsbild der Stadt von der Meerseite. Ende des 19., Anfang des 20. Jahrhunderts erschien die Kathedrale noch grandioser, da sie sich unter überwiegend einstöckigen Gebäuden befand. In ihrer Umgebung gab es nur zwei zweigeschossige europäische Gebäude aus dem 19. Jahrhundert, während die Hauptbebauung rund um die Kathedrale nach ihrer Vollendung entstand, was zu einem großen Teil ihr zu verdanken war.

Bereits 1774 gab es in Gözlü, dem alten Namen von Jewpatorija, eine kleine Kirche des Heiligen Nikolaus, die von den ansässigen Griechen erbaut wurde. 1779 entging die Stadt einer Pestepidemie dank strenger Quarantänemaßnahmen, die von der Militärgarnison unter dem Kommando von A.V. Suworow eingeführt wurden. Suworow besuchte die Kirche des Heiligen Nikolaus und sang im Chor. 2004 wurde in der Nähe der Kathedrale ein Denkmal für Suworow errichtet.

Im Jahr 1805 wurde eine neue Kirche des Heiligen Nikolaus erbaut, die jedoch während des Krimkriegs stark beschädigt und baufällig wurde. Ende des 19. Jahrhunderts stellten die orthodoxen Russen und Griechen fast die Hälfte der Stadtbevölkerung, was den Bedarf an einem neuen Gotteshaus zur Folge hatte.

Der Hochwürdigste Innokentij erwähnte in seinem Bericht an den Heiligen Synod, dass es in der Krim viele Muslime gibt, deren Vorfahren Christen waren. 1859 unterstützte Alexander II. die Eröffnung einer Diözese der Russisch-Orthodoxen Kirche auf der Halbinsel.

Die Heilig-Nikolaus-Kathedrale wurde am 11. Juli 1893 zum Gedenken an die Befreiung Jewpatorijas von den anglo-französisch-türkischen Truppen eingeweiht. Der Bau begann unter der Leitung von Bischof Martinian und Priester Fjodor Turowski. Am 16. Februar 1899 wurde die Kathedrale feierlich von Bischof Nikon geweiht.

Diese Kathedrale wird als Pendant zur Hagia Sophia in Konstantinopel angesehen. Ihre riesige Kuppel, durch Fenster durchbrochen, und die seitlichen Kuppeln verleihen ihr Ähnlichkeit mit dem Tempel im antiken Byzanz.

Der Architekt Alexander Iosifovich Bernardazzi entwarf die Kathedrale für 2000 Gläubige und machte sie zu einem wichtigen Teil des architektonischen Erscheinungsbildes von Jewpatorija. Die Kathedrale, die nach den Berechnungen von V.A. Gereneck ausgeführt wurde, ist ein achteckiges Gebäude mit einer monolithischen Betondecke mit einem Durchmesser von 18 Metern. Diese ingenieurtechnische Neuerung der damaligen Zeit zeichnet sich durch Originalität und Kühnheit aus. Die seitlichen Kuppeln dienen als Stützpfeiler, die die Hauptkuppel unterstützen, während der quadratische Glockenturm die Komposition vollendet.

Bernardazzi fügte die Kathedrale erfolgreich in die Meereslandschaft ein und machte sie zum Zentrum des architektonischen Erscheinungsbildes von Jewpatorija.