L'un des bâtiments les plus remarquables d'Eupatoria est la majestueuse cathédrale Saint-Nicolas, qui se distingue par ses dimensions et sa beauté architecturale, s'élevant au-dessus de l'urbanisme de la ville.

Ce temple est sans aucun doute la principale dominante de la partie historique d'Eupatoria aux côtés de la mosquée Djuma-Djami et de l'église du prophète Élie, formant l'aspect architectural de la ville du côté de la mer. À la fin du XIXe et au début du XXe siècle, la cathédrale semblait encore plus grandiose, car elle se trouvait parmi des bâtiments principalement de plain-pied. Dans son entourage, il n'y avait que deux bâtiments à deux étages de type européen du XIXe siècle, et la construction principale autour de la cathédrale a commencé à se former après son achèvement, en grande partie grâce à elle.

Déjà en 1774, à Gezlève, l'ancien nom d'Eupatoria, il existait une petite église de Saint-Nicolas, construite par des Grecs locaux. En 1779, la ville a échappé à une épidémie de peste grâce à des mesures de quarantaine strictes mises en place par le garnison militaire sous le commandement d'A.V. Souvorov. Souvorov visitait l'église de Saint-Nicolas et chantait dans son chœur. En 2004, un monument à Souvorov a été érigé près de la cathédrale.

En 1805, une nouvelle église de Saint-Nicolas a été construite, mais elle a beaucoup souffert pendant la guerre de Crimée et s'est détériorée. À la fin du XIXe siècle, les Russes orthodoxes et les Grecs constituaient presque la moitié de la population de la ville, ce qui a nécessité la construction d'un nouveau temple.

L'Excellence Innocent, dans son rapport au Saint-Synode, a mentionné qu'il y avait beaucoup de musulmans en Crimée, dont les ancêtres étaient chrétiens. En 1859, Alexandre II a soutenu l'ouverture d'un diocèse de l'Église orthodoxe russe sur la péninsule.

La cathédrale Saint-Nicolas a été posée le 11 juillet 1893 en mémoire de la libération d'Eupatoria des troupes anglo-franco-turques. Sa construction a commencé sous la direction de l'évêque Martinien et du prêtre Fiodor Tourovski. Le 16 février 1899, la cathédrale a été solennellement consacrée par l'évêque Nikon.

Cette cathédrale est considérée comme une réplique de Sainte-Sophie à Constantinople. Son énorme dôme, percé de fenêtres, et ses petits dômes latéraux lui donnent une ressemblance avec un temple de l'ancienne Byzance.

L'architecte Alexandre Iosifovitch Bernardazzi a conçu la cathédrale pour 2000 fidèles, en faisant une partie importante de l'aspect architectural d'Eupatoria. La cathédrale, réalisée selon les calculs de V.A. Gerenek, est un bâtiment octogonal avec un dôme en béton monolithique de 18 mètres de diamètre. Cette innovation technique de l'époque se distingue par son originalité et son audace. Les petits dômes latéraux servent de contreforts, soutenant le dôme principal, tandis que le clocher carré achève la composition.

Bernardazzi a réussi à intégrer la cathédrale dans le paysage maritime, en faisant d'elle le centre de l'aspect architectural d'Eupatoria.