Музей отражает богатую историю своего города. В XVII веке Севск служил пограничной крепостью, защищавшей юго-западные рубежи Московского государства. В 1605 году неподалеку от города состоялась известная битва у села Добрыничи, которой посвящена картина художника М. Решетнева. В разделе древней истории представлено множество экспонатов религиозной тематики, включая иконы, церковные книги и вериги. В XVII веке на территории Севска функционировали два монастыря. В 1778 году была основана Севская духовная семинария. В 1988 году в Севске обнаружили крупнейшее в Европе естественное местонахождение костей мамонтов. В настоящее время музей выставляет кости мамонта и точную копию скелета мамонтенка.