В 1714 году на месте упраздненного деревянного храма святого Николая Чудотворца был заложен каменный храм в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы. В 1743 году его освятили, но в народе он продолжал называться Никольским.

Храм располагался сразу за стенами Софийского двора, на горе, у Никольского взвоза, и своим объемом замыкал Троицкий мыс. Строительство началось еще до петровского указа 1714 года, который запрещал каменное строительство в России, кроме Санкт-Петербурга. Работы возобновились только в 1724 году, и в 1743 году храм был построен и освящен. Его архитектура отражала особенности древнерусского стиля XVII века, включая шатровую колокольню.

Храм несколько раз перестраивался, и окончательная перестройка завершилась в 1774 году. Церковь имела пять престолов: в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы, Входа Господня в Иерусалим, святого великомученика Димитрия Солунского, святого великомученика Георгия Победоносца и святого Николая Чудотворца. В конце XIX века причт состоял из священника и псаломщика, а приход включал 13 деревень.

К началу 1890-х годов, из-за малочисленности и бедности прихожан, храм пришел в крайнюю ветхость, и богослужения проводились редко, так как южная сторона здания отделилась и грозила падением.

Преосвященный Иустин (Полянский) учредил комитет по реставрации храма, поручив сбор пожертвований и проведение работ благочинному Тобольска протоиерею Александру Грамматину. В 1891 году храм был приведен в приличный вид, хотя и не в роскошный.

После революции до начала двадцатых годов в церкви продолжались богослужения, но затем ее превратили в гараж тюрьмы УГБ НКВД. В 1930 году власти города закрыли храм, доведя его до аварийного состояния, а в 1950-е годы он был полностью разрушен.