Кирпичная церковь с одним куполом и колокольней расположена на склоне высокого правого берега реки Эсмань, и её силуэт хорошо виден как с поймы, так и с плато. Благодаря своему выразительному силуэту, храм выступает архитектурной доминантой в застройке села и окружающем ландшафте.

Точная дата основания села Кочерги неизвестна. Первое упоминание о нём содержится в «Путивльской отдельной книге за 1594 год», хранящейся в Российском Государственном архиве древних актов в Москве. Документ сообщает, что в 1590 году «деревня Кочерыжа» была пожалована «детям боярским» Ваське Горяинову сыну Ефремову и Мелешке Осипову сыну Горяинову.

После Деулинского перемирия 1618 года Кочерги перешли к Речи Посполитой. В 1638 году селом завладел Александр Песочинский, который в октябре 1639 года получил на него королевское подтверждение. После изгнания поляков в 1648 году село оставалось свободным. В 1687 году гетман Иван Мазепа передал Кочерги стародубскому полковнику Михаилу Андреевичу Миклашевскому. После его гибели в 1706 году село перешло к его сыну Степану, а затем к внуку Михаилу. Род Миклашевских владел Кочергами до отмены крепостного права в 1861 году.

В XVIII веке в селе была деревянная Николаевская церковь, которая к началу XIX века обветшала. В 1807 году на её месте по заказу и на средства Михаила Петровича Миклашевского был построен новый храм. Он возведён по тому же проекту, что и Воскресенская церковь-усыпальница гетмана Разумовского в Батурине и Успенская в Новом Быкове. Некоторые специалисты считают, что автором проектов всех трёх храмов является архитектор Адам Адамович Менелас. В интерьере храма сохранилось чёрное мраморное надгробие строителя, М.П. Миклашевского, с надписью: «Признательное Семейство Добрейшему Супругу и Отцу». Кирпичная ограда с воротами, облицованная тесаным камнем, была возведена в конце XIX века.

В 1843 году к приходу Николаевской церкви был присоединен приход Симеоновского храма села Ротовки. Ежегодно 15 июля проводился крестный ход на реку в память Крещения Руси.

В 1930-е годы храм был закрыт и использован как зернохранилище, при этом был уничтожен иконостас и другие элементы декора. Надгробие М.П. Миклашевского было расколото и выброшено. Некоторые иконы и утварь спрятал на чердаке своей хаты один пожилой прихожанин. В Кочергах рассказывают, как храму удалось избежать разрушения. Председатель колхоза поручил разобрать купол и колокольню. Мужики пришли с инструментами, но, усевшись на ступенях храма, закурили. Проходящий мимо учитель спросил, зачем они пришли. Узнав о намерении, он сказал: «Зачем ломать, ведь красивый храм, больше ста лет простоял, пускай себе и дальше стоит». Мужики подумали и разошлись.

Литургическая жизнь возродилась во время немецкой оккупации. При открытии храма памятник М.П. Миклашевского был возвращён на место и укреплён металлическими поясами. Старичок вернул все хранившиеся у него реликвии. Однако в последние двадцать лет храм неоднократно обворовывали, похищая ценные иконы и книги. До 2009 года в храме хранился антиминс 1955 года, который был заменён новым из-за ветхости.

Храм сохранил первоначальные формы, не претерпев значительных перестроек. Церковь имеет крестообразный план с полукруглой апсидой и закруглённым западным раменом. Стены расчленены пилястрами, а с трёх сторон расположены четырёхколонные портики тосканского ордера. Над средокрестием возвышается массивный сферический купол на цилиндрическом барабане с круглыми окнами. Над западной частью храма находится небольшая четырёхгранная колокольня.

Архитектура церкви монументальна, декор минимален, и здание выдержано в стиле высокого классицизма. Колонны несут антаблемент, опоясывающий весь храм. Большие окна устроены в арочных нишах, над которыми расположены декоративные элементы. Интерьер освещён хорошо, подкупольный барабан опирается на арки. Рамена креста перекрыты сводами, алтарь и западное рамено заканчиваются конхами. Притвор на первом ярусе колокольни перекрыт сводом.

Церковь построена из кирпича, фундаменты сложены из бутового камня. Снаружи и внутри церковь оштукатурена и побелена. В парусах имеется масляная живопись середины ХХ века. Первоначальный иконостас не сохранился, нынешняя алтарная преграда сооружена во второй половине ХХ века. Пол из досок, крыши и купола покрыты кровельной сталью.

Николаевская церковь в Кочергах, одно из выдающихся храмовых сооружений эпохи высокого классицизма в Украине. Церковь включена в Свод памятников истории и культуры Украины, но до сих пор не внесена в Государственный реестр неподвижных памятников Украины.

С начала 90-х годов ХХ века настоятелем храма является митрофорный протоиерей Виктор Ковалёв. Усилиями батюшки проводится текущий ремонт, хотя храм давно находится в аварийном состоянии: обваливаются карнизы, течет крыша. Не добавляют оптимизма и нападения грабителей, только в 2008-2009 годах таких нападений было три.