Инженер путей сообщения и один из пионеров паровозостроения в России, профессор.

В 1879 году он организовал первую в стране лабораторию для изучения топлива, воды и смазочных материалов на Юго-Западной железной дороге. В период с 1880 по 1882 годы создал первую в мире паровозную лабораторию на базе Киевских мастерских.

Совместно с Л. М. Леви он разработал методику стационарных испытаний паровозов. В 1885 году по проекту Бородина был построен первый паровоз тандем-компаунд.

Он также был одним из основателей и редакторов журнала "Инженер" (1882, Киев) и с 1889 года стал его главным редактором. Русское техническое общество учредило Золотую медаль имени Бородина за выдающиеся изобретения и исследования в области железнодорожного транспорта.