Le monastère masculin de la Transfiguration a été fondé par des moines sous la direction du vieillard Gherasim, arrivés en Sibérie avec les fondateurs de la forteresse d'Irkoutsk. En 1669, ils se sont séparés des cosaques et ont choisi une colline sur la rive gauche de l'Angara pour construire. Le monastère a été posé le 12 décembre 1672 avec la bénédiction du tsar Alexis Mikhaïlovitch Romanov. À cet endroit, deux cellules monastiques et une église en bois de la Transfiguration du Seigneur sont apparues, l'une des premières constructions orthodoxes de l'Est de la Sibérie. En 1678, après un incendie, le monastère a été restauré, et l'église de l'icône de Tikhvine de la Mère de Dieu a été construite, consacrée en 1692. Cette église a acquis un statut miraculeux, car elle est restée intacte après plusieurs incendies, et en 1731, l'évêque irkoutskien Innocent Koulchitski y a été enterré. Cependant, dans les années 1930, elle a été démontée pour du bois de chauffage lors de la construction d'un abattoir.

Une importance particulière dans l'histoire du monastère a été celle de saint Innocent. Il a terminé l'académie spirituelle à Kiev et, sur ordre de Pierre le Grand, a été envoyé à Pékin avec une mission spirituelle, mais n'a pas été autorisé à entrer en Chine. Ayant vécu en Bouriatie pendant environ trois ans, le 15 janvier 1727, il est devenu évêque d'Irkoutsk et de Nerchinsk, et c'est à ce moment-là que l'éparchie d'Irkoutsk a été fondée. Sous sa direction, 37 églises ont été construites à Irkoutsk, et sur le territoire du monastère, la première école a ouvert en 1725, où les enfants étaient enseignés à lire et à écrire. Cependant, à sa place se trouve maintenant une maison en bois. Parmi les constructions restantes du monastère figure un petit bâtiment jaune des anciennes cellules du supérieur, où une école pour les enfants du clergé a également été ouverte plus tard.

Koulchitski a dirigé l'éparchie un peu plus de quatre ans et est mort en 1731. En 1804, il a été canonisé en raison de l'incorruptibilité de ses reliques, qui attiraient des pèlerins de tout le pays, y compris des membres de la famille impériale. Ils s'arrêtaient à l'hôtel du monastère, dont le bâtiment est encore conservé aujourd'hui. Dans les années 1930, le monastère a été détruit, mais les services avaient cessé dès 1925. En 1921, les reliques de saint Innocent ont été emportées dans une direction inconnue et n'ont été retrouvées qu'en 1990 à Yaroslavl. En 1992, des fouilles du monastère ont commencé.

Parmi les constructions restantes du monastère, il y a deux corps de frères, une école, une bibliothèque, un bain et un trésor, qui étaient utilisés comme maisons d'habitation. Les cellules en pierre à deux étages, situées derrière l'arrêt "Mélangeur", ont également été conservées. Une calque de leur image a été trouvée dans les archives de Leningrad. Derrière le terrain vague, l'église de l'Assomption de la Sainte Vierge avec une salle à manger a survécu grâce à son utilisation comme club. Pendant les fouilles, une partie du mur du monastère a été trouvée, ainsi que la tombe du vieillard Gherasim, recouverte d'une plaque en fonte.

Les constructions existantes du monastère ont changé au fil du temps. Les fenêtres du trésor sont restées dans des états variés, et l'église de l'icône de Smolensk de la Mère de Dieu a été détruite lors de la construction de l'abattoir. À la fin du XIXe siècle, le monastère était un centre d'attraction, avec des écoles, des temples, des bibliothèques et des sépultures de bienfaiteurs irkoutsiens célèbres sur son territoire. Cependant, maintenant il ne reste plus rien de tout cela, et à la place du monastère se dressent les tours des usines soviétiques.