En 1766, sur ordre de Catherine II, une prison pour les « fous enchaînés » a été ouverte dans le monastère, qui a fermé en 1905 en raison des événements révolutionnaires. La plupart des détenus étaient ceux qui enfreignaient les canons de l'Église et étaient considérés par le Synode comme des sectaires.

En 1826, par décret, le prophète Abel a été enfermé dans le monastère, où il est mort le 29 novembre 1841 et a été enterré derrière l'autel de l'église Nicolas du monastère.

De 1820 à 1832, le leader de la secte des scoptzy, Kondrati Selivanov, a été détenu dans la prison, où il est également mort. En 1829, le décabriste Fiodor Chakhovskiy y est décédé. À partir de 1869, le leader de la secte des jumpers, Maxim Rudométkin, purgait sa peine dans la prison, s'étant proclamé incarnation du Saint-Esprit en 1857. Dans la prison du monastère, il a écrit 14 livres prophétiques, qui ont été intégrés dans les écritures sacrées des jumpers, le « Livre du soleil », et il est mort en 1877. Au XIXe siècle, des prêtres vieux-croyants étaient détenus dans la « forteresse de Souzdal ». Certains, comme Alimpiy, sont morts dans des cellules individuelles, n'attendant pas leur libération, d'autres, comme Arkadiy, qui a passé 25 ans dans une cellule individuelle, Konon et Gennadiy, ont été libérés en 1881 grâce à Léon Tolstoï. De 1898 à 1904, le vieux-croyant Fiodor Kovalyev a été détenu dans la prison, ayant enterré vivant 25 personnes à cause du recensement de 1897. De 1894 à 1902, le bienfaiteur d'Arkhangelsk, Vasiliy Rakhov, a été emprisonné. De 1898 à 1901, le prêtre orthodoxe Alexey Zertchaninov, qui est devenu catholique, a été détenu ici. En 1900, le fondateur du mouvement des churikovtsy, Ivan Churikov, a passé quatre mois dans la prison du monastère.