En 1766, por orden de Catalina II, se abrió en el monasterio una prisión para "locos encadenados", que cerró en 1905 debido a los eventos revolucionarios. La mayoría de los prisioneros eran aquellos que violaban los cánones de la iglesia y eran considerados por el Sínodo como sectarios.

En 1826, por decreto, fue encarcelado en el monasterio el profeta Abel, quien murió el 29 de noviembre de 1841 y fue enterrado detrás del altar de la iglesia de Nicolás del monasterio.

Desde 1820 hasta 1832, en la prisión estuvo el líder de la secta de los eunucos, Kondratiy Selivanov, quien murió allí mismo. En 1829, aquí falleció el decembrista Fyodor Shakhovskoy. Desde 1869, en la prisión cumplió condena el líder de la secta de los saltadores, Maxim Rudomyotkin, quien se proclamó la encarnación del Espíritu Santo en 1857. En la prisión del monasterio escribió 14 libros proféticos, que fueron incluidos en las escrituras sagradas de los saltadores, "El libro del sol", y murió en 1877. En el siglo XIX, en la "fortaleza de Suzdal" se mantuvieron a clérigos viejos creyentes. Algunos, como Alimpiy, murieron en celdas solitarias, sin esperar su liberación; otros, como Arkadiy, que pasó 25 años en una celda solitaria, Konon y Gennady, fueron liberados en 1881, gracias a Lev Tolstoy. Desde 1898 hasta 1904, en la prisión estuvo el viejo creyente Fyodor Kovalyov, quien enterró vivo a 25 personas debido al censo de 1897. Desde 1894 hasta 1902, en la prisión estuvo el benefactor de Arkhangelsk, Vasiliy Rakhov. Desde 1898 hasta 1901, aquí estuvo el sacerdote ortodoxo Alexey Zertchaninov, quien se convirtió al catolicismo. En 1900, el fundador del movimiento churikovtses, Ivan Churikov, pasó cuatro meses en la prisión del monasterio.