L'église russe dans le Tyrol du Sud est apparue à la fin du XIXe siècle, lorsque ces terres faisaient partie de l'Empire austro-hongrois. À partir du milieu du XIXe siècle, la petite ville de Merano est devenue une station thermale populaire, attirant les Russes par son climat doux et ses paysages alpins pittoresques.

Dans les années 1870, une colonie russe existait déjà à Merano. Pour soutenir les vacanciers russes et leur apporter de l'aide, y compris la recherche de logements abordables, une société caritative privée des habitants russes de Merano, connue sous le nom de Comité russe, a été créée en 1875. Elle était financée par des dons, principalement de médecins locaux.

Les Russes venus se soigner à Merano avaient besoin non seulement de logement, mais aussi de services orthodoxes. Pour de nombreux malades de la tuberculose, les sentiments religieux s'intensifiaient en raison de la prise de conscience de la fragilité de la vie. Loin de leur patrie et dans un environnement culturel étranger, ils ressentaient de la nostalgie pour la Russie. Cela a poussé le comité à s'occuper de la création d'une église. En 1884, le Comité russe, sous la direction du médecin Mikhaïl von Messing, s'est adressé à l'archevêque Isidore pour demander la bénédiction de la création d'une paroisse orthodoxe à Merano au nom de saint Nicolas.

La consécration de l'église à saint Nicolas était symbolique, car il était l'un des saints les plus vénérés en Russie. Le prêtre Jean de Kronstadt, connu comme le "père de toute la Russie", a soutenu la création de l'église par son autorité, bien qu'aucun document concret sur sa participation n'ait été trouvé. Les paroissiens d'aujourd'hui le considèrent comme leur saint patron aux côtés de saint Nicolas.

À l'origine, l'église était située dans un local loué à la villa Stefani, mais il est vite devenu évident qu'un plus grand espace était nécessaire. La fille d'un conseiller de cour, Nadejda Borodina, n'ayant pas pu surmonter sa maladie, a légué une somme importante pour la construction d'un sanatorium pour les malades venus de Russie. En 1897, la construction de la Maison russe nommée Borodina a été achevée, et l'église a été installée au dernier étage d'une annexe, ornée d'un dôme et d'une croix de style russe.

La consécration solennelle de la nouvelle église a eu lieu le 3/15 décembre, à la veille de la fête de saint Nicolas. Pour cet événement, des Russes de toutes les stations voisines du Tyrol se sont rassemblés à Merano. L'église était pleine à craquer, et parmi les visiteurs se trouvaient non seulement des orthodoxes, mais aussi des représentants des autorités locales.

La Maison russe nommée Borodina est devenue un véritable coin de Russie : on y lisait des journaux russes, on y préparait des plats russes, et après la liturgie, un samovar était servi pour le traditionnel goûter de thé.

La Première Guerre mondiale en 1914 a interrompu la vie paisible de la paroisse, et Merano est devenu inaccessible aux Russes. Au XXe siècle, la paroisse a traversé de nombreuses épreuves, et l'église Saint-Nicolas a failli être détruite. Cependant, depuis le début des années 1990, un renouveau de la vie orthodoxe a commencé. Le 9 juin 1991, des services religieux rares ont repris dans l'église, et en 2002, une communauté orthodoxe du Patriarcat de Moscou a été enregistrée. Le premier service pascal a été célébré par le hiéromoine Arsène (Sokolov).

Le 23 mai 2006, le hiéromoine Alexis (Nikonorov) a été nommé guide spirituel de la communauté, et depuis lors, les services religieux ont lieu régulièrement, chaque premier et troisième dimanche du mois.