Après la mort du dernier tsar de la dynastie des Riourik, le boyard Boris Godounov monta sur le trône, ayant fait une carrière brillante et s'étant rapproché du pouvoir sous Ivan le Terrible.

Parmi ses domaines se trouvaient de nombreuses demeures, y compris le domaine "Krasnoe-na-Volge" près de Kostroma, où fut érigée la magnifique église à coupole de l'Épiphanie.

Depuis, beaucoup de temps a passé, mais grâce aux enregistrements dans les livres de paroisse, il est connu que le temple a été fondé en 1592. Les informations sur les bâtisseurs et les donateurs ne se sont pas conservées, mais par le style architectural, on peut supposer que des architectes moscovites ont travaillé dessus.

Les historiens de l'art considèrent l'église de l'Épiphanie comme un exemple classique de l'architecture de l'époque de Boris Godounov. Le temple repose sur un massif soubassement, orné de kokoshniks décoratifs et d'une petite coupole. Le clocher est situé du côté ouest et a été ajouté à la place du porche. Les limites symétriquement abaissées rappellent la célèbre église du village royal d'Ostriv. Malheureusement, les anciennes fresques à l'intérieur ne se sont pas conservées, et il n'y a pas de descriptions des fresques d'avant la révolution, donc les intérieurs ont dû être redécorés.

Au XIXe siècle, la paroisse de l'Épiphanie rassemblait des représentants de différentes classes sociales. Des personnes nobles et riches faisaient des dons généreux pour l'entretien du temple. À la fin du XIXe siècle, grâce aux fonds des croyants, une église de Pierre et Paul a été construite à proximité et un monument à l'empereur Alexandre II a été érigé.

Après l'arrivée au pouvoir des bolcheviks, les deux temples ont été fermés, le monument au tsar a été démoli et l'église de Pierre et Paul a été détruite. Le vieux cimetière n'a également pas survécu, car il a été détruit par le pouvoir soviétique.

Dans les années 1990, le temple de l'Épiphanie a été restitué à l'Église orthodoxe. Après une restauration complète, il a reçu un nouvel iconostase.