Después de la muerte del último zar de la dinastía Rúrik, el boyardo Boris Godunov ascendió al trono, quien hizo una brillante carrera y ya bajo Iván el Terrible se acercó al poder.

Entre sus posesiones había numerosas fincas, incluyendo la propiedad "Krasnoye-na-Volge" cerca de Kostroma, donde se erigió la magnífica iglesia de la Epifanía con cúpula.

Ha pasado mucho tiempo desde entonces, pero gracias a los registros en los libros de la parroquia, se sabe que el templo fue fundado en 1592. La información sobre los constructores y donantes no se ha conservado, pero por el estilo arquitectónico se puede suponer que arquitectos moscovitas trabajaron en él.

Los historiadores del arte consideran que la iglesia de la Epifanía es un ejemplo clásico de la arquitectura de la época de Boris Godunov. El templo se encuentra sobre un macizo podio, adornado con decorativos kokoshniks y una pequeña cúpula. La campanario está ubicado en el lado oeste y fue añadido en lugar del porche. Los límites simétricamente reducidos recuerdan a la famosa iglesia en la aldea real de Ostra. Desafortunadamente, las viejas pinturas en el interior no se han conservado, y tampoco hay descripciones de los frescos de antes de la revolución, por lo que los interiores tuvieron que ser decorados de nuevo.

En el siglo XIX, la parroquia de la Epifanía unía a representantes de diferentes clases sociales. Personas nobles y acaudaladas donaban generosamente para el mantenimiento del templo. A finales del siglo XIX, con los fondos de los creyentes, se construyó cerca la iglesia de Pedro y Pablo y se erigió un monumento al emperador Alejandro II.

Después de la llegada al poder de los bolcheviques, ambos templos fueron cerrados, el monumento al zar fue demolido y la iglesia de Pedro y Pablo fue volada. El antiguo cementerio tampoco se ha conservado, ya que fue destruido por el poder soviético.

En la década de 1990, la iglesia de la Epifanía fue devuelta a la Iglesia Ortodoxa. Después de una restauración completa, recibió un nuevo iconostasio.