L'histoire du Musée d'Art d'Estonie a commencé avec des difficultés dès sa création. Fondé en 1919, le musée n'a obtenu un emplacement permanent qu'en 1921, lorsqu'il s'est installé dans un monument architectural du XVIIIe siècle, le palais de Kadriorg. Cependant, dès 1929, le musée a été contraint de quitter le palais, qui a été nationalisé pour être rénové et transformé en résidence du président d'Estonie.

Depuis 1929, le musée a changé plusieurs fois de locaux temporaires, jusqu'à ce qu'en 1946, le palais de Kadriorg lui soit restitué. Le pouvoir soviétique a apparemment décidé que les palais ne devaient pas servir de lieu pour les réunions gouvernementales. À partir des années 1950, le musée a commencé à fonctionner normalement, enrichissant activement ses collections et élargissant ses espaces d'exposition. À la fin des années 1970, les premières succursales du musée ont vu le jour.

En 1991, le Soviet suprême d'Estonie a décidé de construire un nouveau bâtiment pour le musée en raison de la détérioration de l'état du palais de Kadriorg. La restauration a duré près de neuf ans et a été soutenue par la Suède, qui a alloué 21 millions de couronnes suédoises à cet effet. De 1993 à 2005, le musée a été situé dans le bâtiment de la Chevalerie à Tallinn.

Depuis 1995, les succursales du musée ont commencé à s'engager activement dans des activités éducatives, organisant des cours et des ateliers d'art pour les jeunes. En 1996, une salle d'exposition a ouvert dans l'ancien entrepôt de sel de Rottermann. En 2000, la restauration du palais de Kadriorg a été achevée, devenant une succursale du musée, où l'art étranger est désormais présenté.

Aujourd'hui, le Musée d'Art d'Estonie regroupe plusieurs musées, chacun jouant un rôle important dans la vie culturelle du pays. Parmi eux se trouvent le Musée d'Art de Kadriorg, le musée Adamson-Eric, le musée Niguliste et le musée Mikkel. En février 2006, le Musée d'Art Kumu a ouvert à Kadriorg, devenant le nouveau bâtiment principal du musée.

Après presque cent ans d'existence, le Musée d'Art d'Estonie a enfin trouvé son propre bâtiment, répondant aux exigences modernes. Kumu est un espace multifonctionnel avec des salles d'exposition, des auditoriums pour des activités scientifiques et éducatives, ainsi qu'un centre éducatif pour tous les âges.

La collection du Musée d'Art d'Estonie et de ses succursales compte plus de 55 000 œuvres d'art. Le musée Niguliste propose de découvrir une collection d'art ancien, y compris l'art religieux du Moyen Âge et du baroque, des objets en argent des ateliers et des guildes, ainsi que de la confrérie des Têtes noires.

Le Musée d'Art d'Estonie, qui regroupe cinq musées de Tallinn, conserve environ 60 000 œuvres d'art nationales et étrangères. Le musée de Kadriorg, situé dans le palais éponyme construit par l'architecte Nicolo Miketti, abrite une collection d'art russe du XVIIIe siècle et de la première moitié du XXe siècle.

Parmi les œuvres intéressantes, on trouve « Le Récit du soldat » d'Ilya Répine, « L'Homme au cranberry » d'Ivan Kramskoy, « Poème » de Konstantin Korovine et « La Cour de village » de Valentin Serov. L'art soviétique est représenté par des œuvres telles que « Nouvelle lune de mai » de Konstantin Yuon et « Portrait de Gorki » de Vera Mukhina. Le musée conserve également une collection d'icônes provenant de collections privées.