Die Geschichte des Estnischen Kunstmuseums begann mit Schwierigkeiten sofort nach seiner Gründung. Gegründet im Jahr 1919, erhielt das Museum erst 1921 einen festen Platz, als es im architektonischen Denkmal des 18. Jahrhunderts, dem Kadriorg-Palast, untergebracht wurde. Doch bereits 1929 musste das Museum den Palast verlassen, der nationalisiert wurde, um renoviert und in die Residenz des Präsidenten Estlands umgewandelt zu werden.

Seit 1929 wechselte das Museum mehrmals die vorübergehenden Räumlichkeiten, bis 1946 der Kadriorg-Palast zurückgegeben wurde. Die sowjetische Macht entschied offenbar, dass Paläste nicht als Ort für Regierungssitzungen dienen sollten. Ab den 1950er Jahren begann das Museum, normal zu funktionieren, seine Bestände aktiv zu erweitern und die Ausstellungsflächen zu vergrößern. Ende der 1970er Jahre entstanden die ersten Zweigstellen des Museums.

1991 beschloss der Oberste Rat Estlands den Bau eines neuen Gebäudes für das Museum aufgrund des schlechten Zustands des Kadriorg-Palastes. Die Restaurierung dauerte fast neun Jahre und wurde von Schweden unterstützt, die dafür 21 Millionen schwedische Kronen bereitstellten. Von 1993 bis 2005 befand sich das Museum im Gebäude der Ritterakademie in Tallinn.

Seit 1995 begannen die Zweigstellen des Museums aktiv mit Bildungsaktivitäten, indem sie Unterricht und Kunstworkshops für Jugendliche organisierten. 1996 wurde ein Ausstellungsraum in einem ehemaligen Salzlager von Rotermann eröffnet. Im Jahr 2000 wurde die Restaurierung des Kadriorg-Palastes abgeschlossen, der nun eine Zweigstelle des Museums ist, in der ausländische Kunst präsentiert wird.

Heute vereint das Estnische Kunstmuseum mehrere Museen, von denen jedes eine wichtige Rolle im kulturellen Leben des Landes spielt. Dazu gehören das Kunstmuseum Kadriorg, das Adamson-Eric-Museum, das Niguliste-Museum und das Mikkeli-Museum. Im Februar 2006 wurde im Kadriorg das Kunstmuseum Kumu eröffnet, das zum neuen Hauptgebäude des Museums wurde.

Nach fast einhundert Jahren Bestehen hat das Estnische Kunstmuseum endlich ein eigenes Gebäude, das den modernen Anforderungen entspricht. Kumu ist ein multifunktionaler Raum mit Ausstellungsräumen, Auditorien für wissenschaftliche und Bildungsaktivitäten sowie einem Bildungszentrum für alle Altersgruppen.

Die Sammlung des Estnischen Kunstmuseums und seiner Zweigstellen umfasst mehr als 55.000 Kunstwerke. Das Niguliste-Museum bietet die Möglichkeit, die Sammlung alter Kunst zu besichtigen, einschließlich Kirchenkunst des Mittelalters und des Barock, Silberwaren aus Handwerksbetrieben und Zünften sowie der Bruderschaft der Schwarzköpfe.

Das Estnische Kunstmuseum, das fünf Museen in Tallinn vereint, bewahrt etwa 60.000 Werke nationaler und internationaler Kunst. Das Kadriorg-Museum, das sich im gleichnamigen Palast befindet, der von dem Architekten Nicolo Michetti erbaut wurde, enthält eine Sammlung russischer Kunst des 18. und der ersten Hälfte des 20. Jahrhunderts.

Unter den interessanten Exponaten sind „Die Erzählung des Soldaten“ von Ilja Repin, „Der Bursche mit der Preiselbeere“ von Ivan Kramskoy, „Das Poem“ von Konstantin Korovin und „Der Dorfhof“ von Valentin Serov. Die sowjetische Kunst wird durch Werke wie „Mai-Neumond“ von Konstantin Juon und „Porträt von Gorki“ von Vera Mukhina repräsentiert. Im Museum befindet sich auch eine Sammlung von Ikonen aus privaten Sammlungen.