En Estonie, le seul monument à Pirogov est situé à Tartu, sur la colline de Toomemägi. Son inauguration a eu lieu en décembre 1952. Le parc où se trouve le monument est populaire parmi les étudiants, qui, avec l'arrivée du printemps, se rassemblent à ses pieds. À proximité se trouve l'université où, au XIXe siècle, le célèbre médecin russe partageait ses connaissances avec les futurs médecins. Après l'inauguration du monument, un proverbe est apparu à Tartu : "Les oiseaux arrivent, donc le printemps est là". À Tartu, il se dit : "Les étudiants se rassemblent, donc le printemps est là", car les étudiants de l'université de médecine se rassemblent souvent autour du monument à Pirogov.

La création du monument a été réalisée par un groupe de sculpteurs : J. Raudsepp, P. Tarvas, A. Volberg et M. Melder, mais dans les guides, seul Raudsepp est souvent mentionné.

Le monument représente un buste du chirurgien, érigé sur un haut socle en granit. Sur le socle sont indiqués les années de vie de Nicolas Ivanovitch et son nom en russe. Dans la partie inférieure du deuxième secteur du socle se trouve un blason avec une symbolique médicale.