In Estland befindet sich das einzige Denkmal für Pirogow in Tartu auf dem Hügel Toomemägi. Seine Eröffnung fand im Dezember 1952 statt. Der Park, in dem das Denkmal steht, ist bei Studenten beliebt, die sich mit dem Einzug des Frühlings zu seinen Füßen versammeln. In der Nähe befindet sich die Universität, an der der herausragende russische Mediziner im 19. Jahrhundert sein Wissen mit zukünftigen Ärzten teilte. Nach der Eröffnung des Denkmals entstand in Tartu das Sprichwort: "Vögel fliegen ein, das bedeutet, der Frühling ist gekommen." In Tartu lautet es: "Die Studenten versammeln sich, das bedeutet, der Frühling ist gekommen", da sich die Medizinstudenten oft am Denkmal für Pirogow versammeln.

An der Schaffung des Denkmals war eine Gruppe von Bildhauern beteiligt: J. Raudsepp, P. Tarvas, A. Wolberg und M. Melder, jedoch wird in Reiseführern häufig nur Raudsepp erwähnt.

Das Denkmal besteht aus einem Büsten des Chirurgen, die auf einem hohen Granitsockel steht. Auf dem Sockel sind die Lebensjahre von Nikolai Ivanovich und sein Name in russischer Sprache angegeben. Im unteren Teil des zweiten Sektors des Sockels befindet sich ein Wappen mit medizinischer Symbolik.