Initialement, l'hôpital était situé dans 13 bâtiments en bois séparés. Il comprenait 150 lits, un hospice pour 100 personnes, une maison de travail pour hommes et un foyer pour anciens militaires. Au fil du temps, des filiales de l'hôpital Catherine ont commencé à apparaître dans différents quartiers de Moscou, qui sont ensuite devenues des établissements de santé autonomes : Novo-Catherine, Myasnitskoye, Yauzskoye, Basmannoye, Preobrazhenskoye et d'autres.

En 1835, l'hôpital a été renommé Vieille-Catherine. Après que l'hôpital, organisé sur le boulevard Passion près des portes de Petrov, se soit séparé et ait été appelé Nouveau-Catherine, l'ancien a reçu le nom de Vieille-Catherine.

En 1890, un service de maternité de 7 lits a ouvert dans le bâtiment gynécologique de l'hôpital Vieille-Catherine. Dans ce service, en 1896, le professeur Dmitri Vigilev a réalisé pour la première fois à Moscou une césarienne.

En 1906, deux autres filiales du service de maternité ont été ouvertes.

En 1907, les refuges de maternité ont été réunis en un seul établissement, la Maison de maternité de la ville près de l'hôpital Vieille-Catherine.

En 1908, grâce aux fonds de la famille Morozov, deux étages d'un nouveau bâtiment de la maison de maternité ont été construits.

En 1910, grâce aux dons de mécènes, un bâtiment de trois étages avec une entrée principale du côté de la 3e rue Meshchanskaya a été érigé, portant le nom de "Maison de maternité Morozov près de l'hôpital Vieille-Catherine". Plus tard, son nom a été changé : en 1924, la maison de maternité a été appelée "Maison de maternité prolétarienne". Depuis 1936, elle a fonctionné comme la maison de maternité n°8 du district de Dzerjinski à Moscou.

L'hôpital a changé de nom plusieurs fois : Institut clinique de Moscou (IKM), Institut clinique de la région de Moscou (IKRM, IKRM MedVUZ), Institut clinique de recherche de la région de Moscou (MONIKI).

Depuis 2012, il porte le nom de "Établissement budgétaire d'État de santé de la région de Moscou, Institut clinique de recherche de la région de Moscou" (GBUZ MO MONIKI).