À Paris, le 14 novembre 1888, a eu lieu l'inauguration solennelle de l'Institut Pasteur en présence du président de la France, Marie François Sadi Carnot. Cet établissement scientifique a été construit et équipé grâce à des fonds collectés par souscription internationale, et son premier directeur fut le fondateur de la microbiologie, Louis Pasteur. L'institut a été créé pour soutenir son travail.

L'Institut Pasteur est un centre mondial de premier plan dans l'étude des maladies infectieuses. Des découvertes importantes y ont été faites, contribuant à la lutte contre des maladies telles que la diphtérie, le tétanos, la tuberculose, la poliomyélite, la grippe, la fièvre jaune et la peste. En 1983, le virus VIH y a été découvert.

Depuis 1908, huit scientifiques de l'institut ont reçu le prix Nobel de médecine et de physiologie. Parmi eux se trouvait le scientifique russe Ilia Ilitch Méchnikov, qui a reçu le prix en 1908. Méchnikov a déménagé à Paris en 1887 et a obtenu un laboratoire à l'institut Pasteur. Depuis 1905, il a occupé le poste de directeur adjoint.

Aujourd'hui, l'Institut Pasteur est le plus ancien et le plus grand établissement scientifique et pratique dans le domaine de la microbiologie, de l'épidémiologie et de l'immunologie. Il mène des recherches en biologie, sur les micro-organismes, les maladies infectieuses et les vaccins. L'institut compte plus de 100 laboratoires de recherche, une riche bibliothèque, ainsi que des départements de recherche et d'enseignement, des laboratoires de production de vaccins et de sérums, un hôpital et une école pour former le personnel médical intermédiaire. L'Institut Pasteur est également le centre d'un réseau d'instituts de recherche scientifique, comprenant 24 instituts en dehors de la France, y compris à Saint-Pétersbourg.

L'été 1888, Émile Roux, à la demande de Louis Pasteur, a envoyé à Méchnikov les plans de l'institut en construction et lui a demandé de faire part de ses souhaits concernant l'aménagement de ses chambres. Méchnikov fut le premier que Pasteur invita à travailler à l'institut. En 1888, Méchnikov est arrivé à Paris et a commencé ses recherches sur la phagocytose. De jeunes scientifiques d'Europe affluèrent vers lui. Parmi ses premiers élèves se trouvaient l'Anglais Ruffer et le médecin russe Nicolas Tchistovitch. Plus tard, des scientifiques de France, du Japon, d'Italie, de Belgique et de Roumanie, ainsi que de nombreux scientifiques russes, tels que N.F. Gamaleïa, D.K. Zabolotny et d'autres, se joignirent à eux. Rapidement, deux pièces devinrent trop petites, et Pasteur attribua à Méchnikov le deuxième étage de l'aile sud du bâtiment.

De nombreux chercheurs russes ont passé par le laboratoire de Méchnikov et sont devenus ses élèves. Beaucoup d'entre eux, après avoir travaillé à l'institut pendant plusieurs mois à plusieurs années, retournaient dans leur pays d'origine, où ils occupaient des chaires, organisaient des laboratoires et créaient leurs propres domaines scientifiques.

À l'institut, Alexandre Tchitchkine, connu sous le nom de "roi du lait", a effectué un stage de trois ans. Il a construit un empire commercial et de production et a créé une entreprise socialement orientée.