La formation du fonds du musée a commencé en 1966, lorsque des membres de la section moscovite de l'Union des artistes ont offert les premières peintures au kolkhoze "Kavkaz". Un rôle important dans l'histoire du musée a été joué par le vétéran de la Grande Guerre patriotique Ivan Ivanovitch Protasov. Il a proposé d'élargir le concept du musée en ajoutant un département historique aux expositions d'art visuel. Protasov, devenant le premier directeur du musée du kolkhoze, s'est activement engagé dans la collecte de matériaux sur l'histoire de la stanitsa de Kourganna et du kolkhoze.

Initialement, les peintures et sculptures offertes ont été placées dans le hall du deuxième étage du Palais de la culture du kolkhoze. Les artistes ont constamment enrichi le fonds de la galerie du kolkhoze, et le musée d'art régional nommé Kovalienko a transféré des peintures par achat. Les fonds du musée d'histoire du kolkhoze "Kavkaz" se sont enrichis grâce aux expositions collectées parmi les habitants locaux, ce que faisait également Ivan Ivanovitch Protasov. Grâce à ses efforts, une base a été créée pour la section dédiée à la culture domestique de la population locale du début du XXe siècle. Les habitants de la stanitsa ont activement soutenu l'initiative de Protasov, contribuant à la création de cette nouvelle section muséale.

Avec l'ouverture du nouveau Palais de la culture en 1965, Protasov a proposé d'ouvrir un musée dans l'une de ses salles. À cette époque, les vétérans, partisans et vétérans du travail visitaient souvent Kourganinsk et laissaient en souvenir pour les générations futures des photographies et des objets personnels. En 1972, Andreï Petrovitch Khomiakov a proposé de construire un bâtiment séparé pour le musée, et cette proposition a été unanimement soutenue. Le bâtiment du musée a été construit selon le projet de l'architecte méritant de la RSFSR A.V. Titov et est devenu le seul dans la zone rurale du kraï de Krasnodar, spécialement érigé pour le musée.

Le bâtiment à deux étages avec un toit en verre a embelli la partie centrale de la ville de Kourganinsk. Au premier étage se trouve le musée du kolkhoze "Kavkaz", racontant l'histoire de la ville et du kolkhoze, et au deuxième étage, la galerie d'art, un filiale du musée d'art régional nommé F.A. Kovalienko, depuis le 1er octobre 1975. Par un décret du Ministère de la culture de la RSFSR du 23 décembre 1980, le musée a reçu le titre de "Musée populaire". En 1993, il a été transformé en musée historique de Kourganinsk.

Au fil des ans, les fonds du musée ont augmenté pour atteindre 23 000 expositions, y compris un vaste archive de documents et de photographies, ainsi que des dizaines de collections. En 53 ans, le musée a accueilli environ 900 000 personnes et a organisé plus de trente mille visites guidées.