Le temple a une forme cruciforme traditionnelle pour les bâtiments chrétiens. Au-dessus de son toit incliné se dresse un dôme semi-circulaire, et le porche est orné d'un clocher à deux niveaux avec un toit doré. Les murs de l'église de la Nativité de la Vierge sont peints en bleu et blanc, qui s'harmonisent parfaitement avec la teinte bleue de la mer d'Azov.

L'histoire du temple est indissociable du nom du vieux Sazonte Ivanovitch. Cet ancien marchand et officier, ayant participé à la guerre de Crimée, est devenu par la suite un vieux sage et possédait le don de prévoyance. À l'époque où la ville était encore en pleine construction, des montagnes de déchets de construction s'accumulaient sur ses décharges. Un jour, Sazonte est venu à une réunion des députés de la ville et a demandé qu'on lui attribue un terrain abandonné pour créer un monastère masculin. Au départ, son idée a suscité du scepticisme, mais le terrain a tout de même été attribué. Sazonte a creusé une cellule pour lui-même, est devenu ermite et a commencé à collecter des fonds pour la construction de l'église. Bientôt, il a été soutenu par les habitants orthodoxes de la ville, et le 21 septembre 1904, le jour de la Nativité de la Vierge, la première pierre du futur temple a été posée.

La construction s'est achevée en 1907, et un an plus tard, Sazonte Ivanovitch est décédé et a été enterré dans la crypte de l'église.

Henichesk était connu pour ses maîtres du carillon, qui, lors des fêtes orthodoxes, montaient au clocher, et une mélodie magique résonnait au-dessus de la ville, se reflétant dans les eaux maritimes. Pratiquement tous les habitants de Henichesk et des villages environnants ont participé à la construction du monastère, en faisant des dons d'argent et en apportant de la farine, des légumes et des grains. Dans cette ville steppique sans eau, qui commençait à peine à se construire, l'église de la Nativité de la Vierge est devenue un véritable oasis. Au pied de la colline se trouvaient une piscine, des parterres de fleurs, des potagers et une écurie, tandis qu'au sommet se dressaient le temple et la salle à manger. Une allée menait de l'église, de chaque côté de laquelle embaumaient des roses, et dans la cour, des paons avec leurs petits se promenaient. Dans une petite chapelle à l'entrée, ornée d'icônes, une lampe brûlait, et un moine de garde lisait les Psaumes. De l'autre côté de l'entrée, des cellules étaient creusées dans le sol.

Pendant la révolution et les persécutions des prêtres, les moines accueillaient des réfugiés et leur offraient un abri. Plus tard, sous le régime soviétique, les locaux du monastère ont été utilisés comme entrepôt à grains, et la tombe de Sazonte a été profanée. En 1941, les services religieux dans le temple ont repris, et le père Constantin a officié. Il a un jour raconté aux habitants les crimes des communistes et la tragédie de Vinnitsa, dont il avait été témoin : il avait vu les fouilles de fosses communes, où certaines personnes avaient été enterrées vivantes. Lorsque Henichesk a été libéré par les troupes soviétiques en 1944, le père Constantin a été arrêté sur dénonciation, est mort en prison et a été réhabilité à titre posthume. Peu après son arrestation, le temple a de nouveau été fermé. À l'époque soviétique, les locaux de l'église ont été utilisés comme entrepôts, puis un gymnase a été aménagé pour la police.

Ce n'est qu'en 1989 que l'église de la Nativité de la Vierge a été restituée aux croyants. Grâce à leurs dons, des travaux de restauration ont commencé. Un an plus tard, le dôme de l'église a été restauré dans son apparence originale.