Les chercheurs, en se penchant sur l'histoire de l'Oural et en particulier de la région de Prikamye aux XVIe-XXe siècles, se heurtent souvent à la nécessité d'étudier l'histoire de la célèbre famille russe d'entrepreneurs et de mécènes, les Stroganov. Le 9 avril 1529, les Stroganov reçurent un acte pour les exploitations salinières à Solvichagodsk. Dans la seconde moitié du XVIe siècle, ils élargirent leurs possessions à Perm la Grande. Le premier acte de donation sur les terres de Velikoperm a été délivré par Ivan le Terrible à Grigori Stroganov, ce qui a marqué le début des possessions des Stroganov dans cette région. Les recensements de Perm la Grande des XVIe-XVIIe siècles mentionnent une église en bois dédiée à Saint Nicolas le Thaumaturge dans le district de Solikamsk, au village de Koudymkor. On pense que l'église a été construite à l'initiative et avec le soutien de Grigori Stroganov. Kri voshchikov I.Ya. note qu'entre 1579 et 1623, une église en bois a été construite à Koudymkor. Au XVIIe siècle, l'église possédait d'importantes richesses, y compris des icônes et des livres d'église.

L'ancienneté de la paroisse est confirmée par la présence dans l'église d'une cloche avec l'inscription latine «Gloria Soli Deo» et la date «1646», ainsi que d'un livre de prières de Pierre Mogila de 1647. Malakhov M.V. en parle également.

En 1749, après le partage entre les frères Stroganov, Koudymkor et ses environs échurent à Alexandre Sergeïevitch Stroganov. Il posséda Koudymkar de 1756 à 1811 et construisit un nouveau temple en pierre, l'église Saint-Nicolas, à l'emplacement de l'ancienne église en bois.

Il existe des divergences concernant les dates de construction du temple. Konin G.K. indique les années 1792-1795, tandis que Kri voshchikov I.Ya. estime que le bâtiment a été achevé en 1796. Le temple se composait d'une partie altérative, d'une partie estivale et d'une partie hivernale, et le clocher s'élevait au-dessus des autres constructions. L'architecture du temple alliait des éléments baroques et des ornements géométriques. L'église comptait trois autels : un temple froid au nom des quarante martyrs, un temple chaud au nom de saint Nicolas et un temple au nom de sainte Parascève.

L'architecte de l'église Saint-Nicolas reste encore inconnu. Il existe une version selon laquelle le projet aurait pu être élaboré par Andreï Nikiforovitch Voronikhine, mais il n'y a pas de preuves documentaires à cet égard. Ce problème nécessite une étude plus approfondie.

Au XIXe et au début du XXe siècle, l'église s'engagea activement dans des activités éducatives et caritatives. Au début des années 1870, l'église possédait d'importants terrains. En 1875, il fut décidé que les terres de prairies seraient utilisées par le clergé, tandis que les terres agricoles seraient louées aux paysans.

En 1891, le prêtre de l'église devint Yakov Vassilievitch Shestakov, qui s'engagea activement dans des activités éducatives. En 1892, sous sa direction, une école fut construite près de l'église Melyukhinskaya. Pour son activité, Shestakov reçut des remerciements de la consistance spirituelle de Perm.

En 1917, un période difficile commença pour l'église. Les bolcheviks proclamèrent la séparation de l'église et de l'État, mais contrôlaient en fait ses activités. L'église perdit ses biens, et en 1930, son activité fut complètement interdite. Le bâtiment de l'église fut transformé en musée.

Au cours des années de perestroïka, les croyants commencèrent à revendiquer le retour des bâtiments de l'église. En 1990, le bâtiment fut transféré à la communauté de l'Église orthodoxe russe à Koudymkar. Depuis lors, l'histoire de la renaissance de l'église a commencé. Actuellement, l'église fonctionne conformément à la charte adoptée en 1999 et approuvée par l'archevêque de Perm et de Solikamsk, Afanasy.