La chapelle en pierre à une nef, située dans la maison du supérieur du monastère d'Inkerma, a été construite en 1867 selon le projet de l'architecte D. M. Stroukov. Après la fermeture du monastère, le bâtiment a été remis aux rénovateurs, et en 1931, il est devenu une partie du musée de Sébastopol. Dans les années 1990, l'église a rouvert.

En 1992, la communauté d'Inkerma a repris ses activités après la période soviétique. Des services religieux ont de nouveau eu lieu dans l'ancienne église, la maison du supérieur et le corps des frères ont été restaurés, et le cimetière a été remis en état. Les visiteurs peuvent voir un corridor-tunnel taillé dans la roche par des moines médiévaux, menant à trois anciennes églises troglodytes : celle de saint Martin le Confesseur, celle de saint André l'Apôtre et la principale église-basilique du monastère, dédiée au saint martyr.

Le monastère abrite des fragments des reliques de la tête vénérable du saint martyr Clément, transmis par la laure des Grottes de Kiev. Des travaux de restauration sont également en cours pour le skite de Spassky, situé près du village de Ternovka, près de Sébastopol.