En 1780, sur la haute berge de l'actuelle rivière Moskva, auparavant connue sous le nom de Turosna, des colons du bourg de Klintsy ont achevé la construction d'une église en bois de l'Ascension du Seigneur. À cet endroit se trouvait auparavant la chapelle de l'Ascension, dont la date de construction exacte est inconnue. En 1760, elle a été consacrée comme église du saint Sergius de Radonège, mais a brûlé lors d'un incendie en 1776. Il est connu que la chapelle a été construite par des vieux-croyants, qui, avec la permission de Pierre le Grand, se sont installés ici en 1708. Près de l'église de l'Ascension, en 1804, une cloche à plusieurs niveaux a été érigée et l'église de l'archange Michel a été fondée, dont la construction s'est achevée en 1826. Les habitants de Klintsy appelaient la cloche la plus haute construction en bois de Russie. Avec la croix, sa hauteur atteignait 25 sazhens, soit 54 mètres, et le sonneur devait gravir 150 marches pour atteindre la cloche.

En 1813, une horloge a été installée sur la cloche. Le début de chaque nouvelle heure était marqué par le coup de la grande cloche, et les quarts d'heure par le carillon des petites cloches. En 1904, sur le territoire du bourg, en plus des églises, deux écoles paroissiales ont ouvert : en 1895 pour les garçons et en 1904 pour les filles. En 1912, une chapelle en pierre de saint Nicolas a été construite.

Depuis 1908, sur la base du bourg de Klintsy, le monastère féminin de l'Assomption a été restauré, qui se trouvait auparavant dans les environs de Klintsy et avait été fermé en 1848. Il a existé jusqu'en 1928. En 1930, les deux églises ont été fermées et les biens restants ont été réquisitionnés. La cloche a été démontée pour matériaux de construction, et l'horloge fondue. Dans les années 1930, le territoire du bourg abritait un camp pour les paysans dépossédés, puis une exploitation suburbaines du département de la santé de la ville et une exploitation de la Trust de la restauration publique. En 1972, les restes du territoire du bourg avec la chapelle de Nicolas ont été loués à la communauté de l'église de la Trinité, qui avait perdu son église dans un incendie. La chapelle a été réaménagée et consacrée comme église de saint Nicolas.

En 1995, le bâtiment a été remis à la direction de l'Église orthodoxe russe. En 2005, par décision du Saint-Synode, le monastère féminin de saint Nicolas de Klintsy a été créé.