Im Jahr 1780 beendeten Siedler aus dem Ort Klintsy den Bau einer hölzernen Kirche zur Himmelfahrt des Herrn am hohen Ufer des heutigen Flusses Moskwka, der früher als Turosna bekannt war. An diesem Ort befand sich zuvor die Himmelfahrtskapelle, deren genaue Bauzeit unbekannt ist. Im Jahr 1760 wurde sie als Kirche des Heiligen Sergius von Radonesch geweiht, brannte jedoch während des Brandes von 1776 nieder. Es ist bekannt, dass die Kapelle von Altgläubigen erbaut wurde, die mit Erlaubnis von Peter dem Großen 1708 hier siedelten. Neben der Himmelfahrtskirche wurde 1804 ein mehrstöckiger Glockenturm errichtet und der Bau der Kirche des Erzengels Michael begonnen, dessen Fertigstellung 1826 erfolgte. Die Klintsy-Bewohner bezeichneten den Glockenturm als das höchste Holzgebäude in Russland. Zusammen mit dem Kreuz hatte er eine Höhe von 25 Werten oder 54 Metern, und der Glockenläuter musste 150 Stufen überwinden, um zur Glockenstube zu gelangen.

Im Jahr 1813 wurden Uhren am Glockenturm installiert. Der Beginn jeder neuen Stunde wurde durch das Schlagen der großen Glocke markiert, und jede Viertelstunde durch das Geläut der kleinen Glocken. Bis 1904 wurden im Gebiet des Ortes neben den Kirchen zwei Pfarrschulen eröffnet: 1895 für Jungen und 1904 für Mädchen. Im Jahr 1912 wurde eine steinerne Nikolai-Überwachungskapelle erbaut.

Seit 1908 wurde auf der Grundlage des Ortes Klintsy das Uspenski-Frauenkloster wiederbelebt, das zuvor in der Umgebung von Klintsy gelegen hatte und 1848 geschlossen wurde. Es bestand bis 1928. Im Jahr 1930 wurden beide Kirchen geschlossen und das verbleibende Eigentum beschlagnahmt. Der Glockenturm wurde für Baumaterialien abgerissen und die Uhren eingeschmolzen. In den 1930er Jahren befand sich auf dem Gebiet des Ortes ein Lager für enteignete Bauern, danach ein Vorortbetrieb des städtischen Gesundheitsamtes und ein Nebenerwerb des Trusts für öffentliche Verpflegung. Im Jahr 1972 wurde der Rest des Gebiets des Ortes mit der Nikolai-Kapelle an die Gemeinde der Dreifaltigkeitskirche übergeben, die ihren Tempel bei einem Brand verloren hatte. Die Kapelle wurde umgestaltet und als Kirche des Heiligen Nikolaus von Myra geweiht.

Im Jahr 1995 wurde das Gebäude der Russischen Orthodoxen Kirche übergeben. Im Jahr 2005 wurde durch Beschluss des Heiligen Synods das Heilige-Nikolai-Klintsy-Frauenkloster gegründet.