En 1780, en la alta orilla del actual río Moskovka, anteriormente conocido como Turosna, los colonos del asentamiento Klinzi terminaron la construcción de una iglesia de madera dedicada a la Ascensión del Señor. En este lugar anteriormente se encontraba la capilla de la Ascensión, cuya fecha exacta de construcción se desconoce. En 1760 fue consagrada como iglesia del Santo Serguéi de Radónezh, pero se quemó durante el incendio de 1776. Se sabe que la capilla fue construida por viejos creyentes que, con el permiso de Pedro el Grande, se establecieron aquí en 1708. Junto a la iglesia de la Ascensión, en 1804 se erigió un campanario de varios niveles y se inició la construcción de la iglesia del Arcángel Miguel, que se completó en 1826. Los habitantes de Klinzi llamaban al campanario la estructura de madera más alta de Rusia. Junto con la cruz, su altura alcanzaba 25 sazhenes, o 54 metros, y el campanero tenía que subir 150 escalones para llegar a la campana.

En 1813, se instalaron relojes en el campanario. El inicio de cada nueva hora se marcaba con el golpe de la gran campana, y los cuartos de hora, con el repique de las pequeñas campanas. Para 1904, en el territorio del asentamiento, además de las iglesias, se abrieron dos escuelas parroquiales: en 1895 para niños y en 1904 para niñas. En 1912 se construyó una capilla de piedra de San Nicolás.

Desde 1908, sobre la base del asentamiento Klinzi, se reactivó el monasterio femenino de la Asunción, que anteriormente se encontraba en las cercanías de Klinzi y fue cerrado en 1848. Existió hasta 1928. En 1930, ambas iglesias fueron cerradas y los bienes restantes fueron requisados. El campanario fue desmantelado para materiales de construcción, y los relojes fueron fundidos. En la década de 1930, en el territorio del asentamiento se ubicó un campo para campesinos despojados, luego una granja suburbana del departamento de salud de la ciudad y una granja auxiliar de la Asociación de Alimentación Pública. En 1972, los restos del territorio del asentamiento con la capilla de San Nicolás fueron arrendados a la comunidad de la iglesia de la Trinidad, que había perdido su templo en un incendio. La capilla fue remodelada y consagrada como iglesia de San Nicolás.

En 1995, el edificio fue transferido a la administración de la Iglesia Ortodoxa Rusa. En 2005, por decisión del Sínodo Sagrado, se formó el monasterio femenino de San Nicolás de Klinzi.