L'église en pierre a été construite par les paroissiens en 1685. Auparavant, à cet endroit se trouvait une église en bois dédiée à la Nativité de la Vierge avec une chapelle en l'honneur de Saint Nicolas le Miracleux.

En 1649, les habitants du faubourg de Nikitska se sont joints à la paroisse de la Nativité de la Vierge. Ils ont été déplacés à Kalouga, ravagée pendant le Temps des Troubles, par ordre d'Ivan Nikititch Romanov depuis le village commerçant de Spasskoïe (aujourd'hui Kievka). À la demande des nouveaux paroissiens, en mémoire de l'église du village de Spasskoïe, la chapelle de Saint Nicolas a été remplacée par celle du grand martyr Nikita, d'où le nom de l'église, Nikitski. Après l'incendie de 1754, l'église a été restaurée en 1755. En 1820, une chapelle en l'honneur de Saint Jean Chrysostome a été ajoutée.

L'église avait un massif carré avec des demi-colonnes décoratives aux coins, des encadrements, une large corniche et de fausses arcades. De chaque côté de l'autel, aux entrées latérales, des galeries avec des colonnes ont été aménagées, avec dix colonnes chacune. Le clocher était octogonal et à quatre niveaux. L'église Nikitski est reconnue comme un monument d'architecture et d'urbanisme d'importance locale (décision du comité exécutif de la région de Kalouga n° 35 du 4 avril 1991).

Depuis la création de l'évêché de Kalouga jusqu'à l'achèvement de la construction de la cathédrale de la Sainte-Trinité, de 1799 à 1819, ce temple abritait le siège des évêques gouvernants de Kalouga. Plusieurs icônes anciennes étaient vénérées dans l'église, y compris l'image du grand martyr Nikita (XVIIe siècle).

L'église a été fermée dans les années 1920. Initialement, elle a été utilisée par le ministère de la Défense comme entrepôt. En mars 1929, à la demande de la faction du VKP(b) du conseil municipal, les niveaux supérieurs du clocher et le dôme central ont été démolis, et l'église elle-même a été réaménagée. Depuis 1939, un cinéma appelé « Pioner » était installé dans l'église. Dans les années 1990, des structures commerciales y étaient également présentes.

Depuis 1993, l'évêché a à plusieurs reprises demandé le retour de l'église pour sa restauration et la reprise des services religieux. Ce n'est qu'en octobre 2004 que, par décision de la Douma de la ville de Kalouga, l'église a été transférée à l'évêché de Kalouga.

En janvier 2005, les travaux de restauration de l'église ont été confiés au diacre Alexeï Pelevine.

Les travaux de restauration ont commencé en avril 2005. De nombreuses tâches se présentaient à l'abbé Alexeï : démontage des cloisons intérieures, évacuation des déchets, finition intérieure des locaux, renforcement des fondations, restauration des bulbes du carré, installation des croix et des dômes, construction du clocher, acquisition de l'argenterie d'église et aménagement de l'espace vert à côté de l'église.

Pour Pâques 2005, une librairie ecclésiastique a été ouverte.

Le 28 septembre 2005, après plus de 80 ans d'interruption, le premier service religieux (une prière avec un akathiste) a eu lieu dans l'église Nikitski, célébré par l'archimandrite Nikita (Ananiev) et le prêtre Alexeï Pelevine.

Le 18 janvier 2006, la première Divine Liturgie a eu lieu.

Pour l'Annonciation de 2009, la première sonnerie des cloches a retenti depuis le clocher de l'église Nikitski.

Une vaste bibliothèque orthodoxe est en activité dans l'église, où adultes et enfants peuvent se rassembler pour lire. Des conférences, des discussions orthodoxes et des rencontres y sont organisées. Le fonds de la bibliothèque est constamment enrichi de nouveaux livres.

Une école du dimanche a été organisée pour les paroissiens. Les cours sont destinés aussi bien aux enfants qu'aux adultes. Un centre d'éducation spirituelle et d'enseignement fonctionne sur la base de l'école du dimanche.